More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0940 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  899    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  78.84 
 
 
432 aa  727    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  97.23 
 
 
433 aa  874    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  43.95 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  32.18 
 
 
574 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.18 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  29.22 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  27.71 
 
 
454 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  31.42 
 
 
475 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  29.36 
 
 
469 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  28.73 
 
 
440 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  31.44 
 
 
543 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  30.36 
 
 
473 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  28.31 
 
 
451 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  28.31 
 
 
451 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  28.18 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  32.36 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30.16 
 
 
448 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  28.47 
 
 
452 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  26.71 
 
 
464 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  30.13 
 
 
436 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  26.33 
 
 
432 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  29.62 
 
 
454 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  28.05 
 
 
452 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  30.86 
 
 
437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  27.89 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  34.73 
 
 
445 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.43 
 
 
448 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.81 
 
 
476 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  34.3 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.96 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  34.3 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  32.91 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  28.6 
 
 
454 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.54 
 
 
558 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  30.43 
 
 
441 aa  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  28.28 
 
 
445 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.25 
 
 
562 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  28.28 
 
 
629 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  30.65 
 
 
448 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  31.75 
 
 
470 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  30.34 
 
 
455 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  30.24 
 
 
499 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  29.3 
 
 
440 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  32.83 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.67 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  31.94 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  33.79 
 
 
563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  34.63 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  32.26 
 
 
445 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  32.05 
 
 
483 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  24.62 
 
 
495 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  30.79 
 
 
562 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  34.82 
 
 
453 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  24.62 
 
 
495 aa  144  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  28.11 
 
 
477 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  25.29 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  32.79 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.25 
 
 
556 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  34.23 
 
 
561 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 
462 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  29.88 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.66 
 
 
568 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  27.8 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.68 
 
 
559 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.3 
 
 
558 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  35.66 
 
 
578 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.37 
 
 
558 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  36.73 
 
 
552 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  36.03 
 
 
556 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  34.85 
 
 
561 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.59 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.7 
 
 
563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.99 
 
 
556 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.09 
 
 
555 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 
447 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  30.37 
 
 
629 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  29.79 
 
 
486 aa  137  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30 
 
 
458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  27.59 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  34.85 
 
 
584 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  25.85 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 
571 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.29 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.29 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.56 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.18 
 
 
582 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.45 
 
 
554 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  32 
 
 
532 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  29.97 
 
 
619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 
558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.98 
 
 
585 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  29.97 
 
 
619 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4857  ABC-1 domain protein  35.32 
 
 
646 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.982247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  36.06 
 
 
558 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  32.95 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  36.68 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  25.58 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>