More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3885 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
532 aa  1052    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  39.72 
 
 
540 aa  345  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2681  2-octaprenylphenol hydroxylase  40 
 
 
539 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.58 
 
 
537 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 
565 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 
565 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.44 
 
 
563 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  32.44 
 
 
599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  28.57 
 
 
537 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
560 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  32.23 
 
 
560 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  27.34 
 
 
558 aa  234  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.77 
 
 
564 aa  233  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  28.35 
 
 
561 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.95 
 
 
568 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.62 
 
 
559 aa  230  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  32.34 
 
 
543 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  32.34 
 
 
556 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  32.34 
 
 
543 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.43 
 
 
561 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.7 
 
 
558 aa  226  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.21 
 
 
557 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.27 
 
 
561 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  30.04 
 
 
559 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.33 
 
 
592 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  30.88 
 
 
547 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.88 
 
 
559 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  31.31 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  30.77 
 
 
558 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  30.37 
 
 
606 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  29.71 
 
 
557 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.81 
 
 
555 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.5 
 
 
559 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  31.45 
 
 
560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  31.87 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  32 
 
 
559 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.78 
 
 
561 aa  213  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.42 
 
 
559 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  32.76 
 
 
549 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.35 
 
 
558 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.99 
 
 
530 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  32.27 
 
 
549 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  32.4 
 
 
557 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  29.83 
 
 
581 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  28.2 
 
 
565 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  30.77 
 
 
544 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  30.39 
 
 
557 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  25.36 
 
 
558 aa  204  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.42 
 
 
558 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.68 
 
 
554 aa  203  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.21 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 
557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  30.55 
 
 
544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  32.78 
 
 
544 aa  201  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  28.42 
 
 
558 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.63 
 
 
573 aa  200  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.53 
 
 
549 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.91 
 
 
559 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  29.52 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.23 
 
 
547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.78 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  29.52 
 
 
571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  29.49 
 
 
582 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  29.81 
 
 
562 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  28.46 
 
 
555 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.19 
 
 
584 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  29.05 
 
 
552 aa  194  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.65 
 
 
558 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  28.18 
 
 
550 aa  193  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  28.6 
 
 
561 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.58 
 
 
501 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  28.54 
 
 
584 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.22 
 
 
549 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.51 
 
 
509 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.04 
 
 
546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  31.13 
 
 
556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  29.69 
 
 
591 aa  190  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.96 
 
 
501 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  27.86 
 
 
585 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  31.19 
 
 
542 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  32.23 
 
 
582 aa  187  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  31.96 
 
 
582 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  30.83 
 
 
566 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  28.14 
 
 
586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  28.99 
 
 
555 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  26.25 
 
 
562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  26.25 
 
 
562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  28.67 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 
582 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2150  ABC1 family protein  31.05 
 
 
648 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  30.27 
 
 
574 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  28.6 
 
 
551 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  27.73 
 
 
549 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  28.36 
 
 
578 aa  183  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.87 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  27.73 
 
 
549 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.46 
 
 
506 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  30.5 
 
 
572 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>