More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4764 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 		 501 aa  952    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  60.28 
 
 		 501 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  42.22 
 
 		 544 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  45.13 
 
 		 543 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  41.7 
 
 		 544 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  43.71 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  44.18 
 
 		 543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  44.18 
 
 		 556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  42.76 
 
 		 568 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  41.77 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.81 
 
 		 558 aa  326  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.31 
 
 		 561 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.71 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  39.53 
 
 		 559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.39 
 
 		 592 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  38.83 
 
 		 582 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  39.89 
 
 		 586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  36.76 
 
 		 581 aa  310  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  39.44 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.25 
 
 		 584 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  38.01 
 
 		 591 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  38.62 
 
 		 582 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.98 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  37.95 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  34.54 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.19 
 
 		 559 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.18 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.19 
 
 		 559 aa  263  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.18 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 565 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  35.96 
 
 		 557 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.16 
 
 		 557 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.38 
 
 		 563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  35.53 
 
 		 559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.98 
 
 		 561 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  37.44 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  30.89 
 
 		 561 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.53 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.26 
 
 		 558 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.9 
 
 		 561 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.48 
 
 		 552 aa  247  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 		 560 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.25 
 
 		 558 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.59 
 
 		 554 aa  246  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  34.97 
 
 		 560 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.52 
 
 		 558 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  33.72 
 
 		 551 aa  239  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  27.64 
 
 		 564 aa  239  9e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.46 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.15 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  34.78 
 
 		 550 aa  229  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  31.54 
 
 		 556 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.04 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.17 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.43 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  36.27 
 
 		 560 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.31 
 
 		 573 aa  226  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  30.63 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.8 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  34.98 
 
 		 558 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28.11 
 
 		 558 aa  223  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  32.35 
 
 		 556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  34.85 
 
 		 549 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  34.58 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  32.08 
 
 		 666 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  30.56 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  32.01 
 
 		 659 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.98 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  28.95 
 
 		 562 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  28.95 
 
 		 562 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.03 
 
 		 530 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  30.84 
 
 		 555 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  30.75 
 
 		 555 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  31.08 
 
 		 665 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  31.08 
 
 		 665 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  29.32 
 
 		 670 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  36.78 
 
 		 652 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  30.52 
 
 		 555 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  33.98 
 
 		 547 aa  209  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  30.81 
 
 		 582 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  31.08 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.29 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  30.92 
 
 		 547 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.02 
 
 		 559 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.85 
 
 		 544 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.77 
 
 		 537 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.83 
 
 		 563 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  29.23 
 
 		 561 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.9 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.9 
 
 		 565 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.81 
 
 		 552 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  36.98 
 
 		 556 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.01 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.72 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.71 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.78 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  28.33 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>