More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3247 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  55.32 
 
 
558 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  100 
 
 
558 aa  1123    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  57.17 
 
 
557 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  53.41 
 
 
558 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  49.73 
 
 
562 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  44.98 
 
 
558 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.34 
 
 
554 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.77 
 
 
558 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  38.86 
 
 
557 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  36.59 
 
 
561 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.25 
 
 
561 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.14 
 
 
561 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.16 
 
 
573 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.32 
 
 
563 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  37.43 
 
 
556 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  35.66 
 
 
560 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  35.84 
 
 
560 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  35.71 
 
 
565 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  40.44 
 
 
544 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.96 
 
 
559 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  36.1 
 
 
564 aa  366  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.61 
 
 
559 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.43 
 
 
559 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.5 
 
 
557 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  35.62 
 
 
559 aa  342  8e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  35.23 
 
 
581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.12 
 
 
558 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.16 
 
 
599 aa  334  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.41 
 
 
549 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.04 
 
 
552 aa  331  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  36.58 
 
 
551 aa  327  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.99 
 
 
568 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  36.17 
 
 
560 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 
582 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.5 
 
 
561 aa  323  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  35.68 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  33.65 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  33.85 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  34.71 
 
 
558 aa  321  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.55 
 
 
557 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.02 
 
 
559 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.47 
 
 
555 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  36.09 
 
 
561 aa  316  8e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.11 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  33.65 
 
 
556 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  33.97 
 
 
591 aa  312  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.87 
 
 
559 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  32.07 
 
 
558 aa  310  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  34.44 
 
 
584 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.33 
 
 
592 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  33.51 
 
 
560 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.76 
 
 
585 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  34.23 
 
 
561 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.71 
 
 
584 aa  306  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  34.48 
 
 
578 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  33.33 
 
 
582 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  31.18 
 
 
547 aa  299  9e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.95 
 
 
563 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  33.22 
 
 
582 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  33.58 
 
 
555 aa  296  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.84 
 
 
582 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.89 
 
 
537 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  32.43 
 
 
537 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  32.38 
 
 
571 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.52 
 
 
571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.1 
 
 
552 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.17 
 
 
530 aa  282  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33.27 
 
 
565 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33.27 
 
 
565 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.74 
 
 
556 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  31.82 
 
 
543 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  31.58 
 
 
547 aa  278  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  31.82 
 
 
556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  31.82 
 
 
543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
549 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.2 
 
 
534 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  31.42 
 
 
545 aa  273  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  30.78 
 
 
550 aa  272  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  32.87 
 
 
549 aa  269  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.33 
 
 
553 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  32.04 
 
 
559 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  31.37 
 
 
549 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  33.62 
 
 
549 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  31.37 
 
 
549 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  29.91 
 
 
565 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.36 
 
 
525 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.6 
 
 
547 aa  262  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.45 
 
 
553 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  30.66 
 
 
562 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.26 
 
 
549 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  33.19 
 
 
549 aa  259  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  30.82 
 
 
562 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.48 
 
 
533 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.48 
 
 
533 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  32.38 
 
 
542 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.53 
 
 
525 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.08 
 
 
549 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.13 
 
 
547 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  31.63 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>