More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0994 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 		 559 aa  1124    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.38 
 
 		 559 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  50.09 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.46 
 
 		 584 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.25 
 
 		 561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  49.74 
 
 		 581 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.44 
 
 		 558 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  51.81 
 
 		 582 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  48.21 
 
 		 560 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  51.99 
 
 		 582 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  49.74 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  48.52 
 
 		 582 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.64 
 
 		 592 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  46.47 
 
 		 591 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  46.52 
 
 		 568 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.95 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  38.04 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.86 
 
 		 561 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  39.46 
 
 		 544 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  39.82 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  39.39 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  39.39 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  39.21 
 
 		 543 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.32 
 
 		 560 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.19 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.14 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  41.41 
 
 		 560 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  40.59 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  34.61 
 
 		 564 aa  362  7.0000000000000005e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  35.45 
 
 		 565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.9 
 
 		 599 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  38.11 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.46 
 
 		 559 aa  337  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.75 
 
 		 559 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  34.57 
 
 		 558 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.26 
 
 		 501 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.64 
 
 		 557 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  34.35 
 
 		 547 aa  325  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 		 558 aa  323  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.37 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.92 
 
 		 558 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  36.27 
 
 		 562 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.12 
 
 		 501 aa  310  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.09 
 
 		 556 aa  306  8.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.05 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.86 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.23 
 
 		 555 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.89 
 
 		 558 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  34.04 
 
 		 555 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.51 
 
 		 557 aa  299  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  35.07 
 
 		 557 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.67 
 
 		 558 aa  296  7e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  33.16 
 
 		 552 aa  296  7e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.92 
 
 		 552 aa  289  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.96 
 
 		 559 aa  289  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  35.57 
 
 		 556 aa  279  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.05 
 
 		 547 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  30.91 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.4 
 
 		 549 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.66 
 
 		 549 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  30.36 
 
 		 606 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.48 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.23 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.64 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  35.2 
 
 		 585 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.42 
 
 		 537 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 		 565 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 		 565 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.4 
 
 		 563 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.91 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.65 
 
 		 559 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.53 
 
 		 550 aa  256  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.62 
 
 		 573 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  32.44 
 
 		 545 aa  256  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  34.1 
 
 		 582 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.9 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.27 
 
 		 560 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.3 
 
 		 547 aa  253  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.06 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  31.11 
 
 		 561 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.34 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  32.71 
 
 		 558 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.02 
 
 		 549 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  31.31 
 
 		 550 aa  248  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  29.2 
 
 		 565 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.17 
 
 		 557 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  28.62 
 
 		 549 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.91 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  36.94 
 
 		 544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 		 586 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.97 
 
 		 522 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  30.23 
 
 		 547 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.2 
 
 		 549 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.2 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.51 
 
 		 514 aa  243  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  32.01 
 
 		 551 aa  243  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  28.45 
 
 		 549 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.69 
 
 		 584 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  30.17 
 
 		 571 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>