More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1817 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1140    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.1 
 
 
559 aa  332  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.1 
 
 
558 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  34.38 
 
 
561 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.15 
 
 
573 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.92 
 
 
561 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.28 
 
 
559 aa  323  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.51 
 
 
554 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.77 
 
 
599 aa  322  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.39 
 
 
561 aa  319  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.46 
 
 
568 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.87 
 
 
559 aa  317  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.98 
 
 
558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.67 
 
 
551 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.24 
 
 
556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.99 
 
 
557 aa  306  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.22 
 
 
563 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.45 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.8 
 
 
557 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.66 
 
 
555 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.88 
 
 
560 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  33.33 
 
 
558 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33.51 
 
 
565 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33.51 
 
 
565 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  30.12 
 
 
560 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.91 
 
 
556 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.86 
 
 
558 aa  291  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.69 
 
 
561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.27 
 
 
552 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  32.33 
 
 
559 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.74 
 
 
552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  32.03 
 
 
560 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.19 
 
 
547 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  32.94 
 
 
582 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.55 
 
 
584 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  33.6 
 
 
542 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 
562 aa  279  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 
558 aa  279  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.32 
 
 
561 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.91 
 
 
559 aa  276  7e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.3 
 
 
557 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  32.83 
 
 
581 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.08 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.2 
 
 
546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.76 
 
 
558 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.26 
 
 
578 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.72 
 
 
581 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.84 
 
 
530 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.36 
 
 
585 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.44 
 
 
558 aa  273  8.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.75 
 
 
549 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  29.56 
 
 
565 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  32.84 
 
 
582 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.28 
 
 
592 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.74 
 
 
509 aa  270  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.26 
 
 
553 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.96 
 
 
561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.97 
 
 
514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.96 
 
 
584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  34.04 
 
 
545 aa  267  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.33 
 
 
506 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.91 
 
 
557 aa  266  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  30.89 
 
 
563 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.76 
 
 
559 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.32 
 
 
549 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.19 
 
 
549 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.81 
 
 
582 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.23 
 
 
553 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  31.38 
 
 
582 aa  261  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  33.06 
 
 
544 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.39 
 
 
547 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  31.8 
 
 
549 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  30.55 
 
 
547 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  31.59 
 
 
549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30 
 
 
549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  31.08 
 
 
591 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.81 
 
 
549 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.35 
 
 
547 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.6 
 
 
522 aa  253  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.96 
 
 
547 aa  253  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.68 
 
 
551 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.68 
 
 
525 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.09 
 
 
504 aa  250  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.42 
 
 
534 aa  250  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.5 
 
 
549 aa  250  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.68 
 
 
525 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.68 
 
 
525 aa  250  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.08 
 
 
561 aa  250  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  29.94 
 
 
560 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.27 
 
 
517 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.98 
 
 
552 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  35.31 
 
 
572 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  34.85 
 
 
592 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  27.22 
 
 
537 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  33.47 
 
 
541 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  28.82 
 
 
562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  28.82 
 
 
562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.4 
 
 
537 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.55 
 
 
547 aa  245  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.06 
 
 
546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>