More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1088 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  100 
 
 
561 aa  1128    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  72.73 
 
 
561 aa  868    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  60.61 
 
 
560 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  84.85 
 
 
561 aa  980    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  61.14 
 
 
560 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  53.46 
 
 
563 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  40.65 
 
 
599 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  40.18 
 
 
565 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  40.17 
 
 
581 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.97 
 
 
554 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.29 
 
 
592 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.21 
 
 
584 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.35 
 
 
561 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  40.1 
 
 
581 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.32 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.4 
 
 
559 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.5 
 
 
559 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.95 
 
 
558 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  36.98 
 
 
564 aa  409  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  38.43 
 
 
582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  37.57 
 
 
559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.41 
 
 
568 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.86 
 
 
559 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  39.48 
 
 
582 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.43 
 
 
558 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.59 
 
 
557 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  38.74 
 
 
582 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  37.46 
 
 
591 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  36.31 
 
 
558 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  36.11 
 
 
557 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  36.3 
 
 
560 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  36.74 
 
 
558 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  34.22 
 
 
558 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.13 
 
 
559 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  34.11 
 
 
558 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  39.42 
 
 
552 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  34.9 
 
 
556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  37.29 
 
 
562 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  39.53 
 
 
556 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.97 
 
 
551 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.69 
 
 
573 aa  343  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  33.94 
 
 
547 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  35.15 
 
 
552 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.61 
 
 
557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.61 
 
 
543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  34.43 
 
 
543 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.49 
 
 
558 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.38 
 
 
555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  34.43 
 
 
556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  31.65 
 
 
537 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.89 
 
 
549 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  37.65 
 
 
560 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  33.92 
 
 
571 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  31.93 
 
 
537 aa  323  7e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.76 
 
 
565 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.76 
 
 
565 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  40.54 
 
 
544 aa  321  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  34.24 
 
 
555 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.48 
 
 
544 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  38 
 
 
558 aa  319  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  34.12 
 
 
544 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  35.08 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.14 
 
 
582 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.7 
 
 
547 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.23 
 
 
561 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.15 
 
 
551 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.42 
 
 
549 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  32.09 
 
 
547 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.8 
 
 
557 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.05 
 
 
563 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  32.39 
 
 
584 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.76 
 
 
585 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  34.99 
 
 
549 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.68 
 
 
549 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  36.12 
 
 
557 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 
561 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.19 
 
 
578 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.91 
 
 
559 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.58 
 
 
530 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.96 
 
 
557 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
549 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.99 
 
 
542 aa  293  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.71 
 
 
547 aa  292  8e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.88 
 
 
546 aa  292  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.82 
 
 
550 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  33.47 
 
 
560 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30.3 
 
 
549 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.55 
 
 
534 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30.12 
 
 
549 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  33.6 
 
 
606 aa  288  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  32.81 
 
 
547 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  32.44 
 
 
586 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.9 
 
 
527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.75 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.83 
 
 
540 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  33.46 
 
 
545 aa  283  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.63 
 
 
557 aa  283  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.57 
 
 
533 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.62 
 
 
553 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.04 
 
 
561 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>