More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2561 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  54.95 
 
 
558 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  100 
 
 
558 aa  1119    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  69.35 
 
 
557 aa  793    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  53.41 
 
 
558 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  50.18 
 
 
558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  50.27 
 
 
562 aa  548  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.04 
 
 
554 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.41 
 
 
558 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  39.35 
 
 
556 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  40.39 
 
 
557 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.99 
 
 
573 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  37.79 
 
 
565 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.41 
 
 
563 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.74 
 
 
561 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  41.81 
 
 
557 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.94 
 
 
559 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  34.53 
 
 
561 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.98 
 
 
561 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.96 
 
 
559 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.57 
 
 
549 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  37.7 
 
 
599 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.7 
 
 
559 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  33.87 
 
 
560 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  40.04 
 
 
544 aa  346  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  35.56 
 
 
564 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  35.68 
 
 
552 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  33.69 
 
 
560 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.47 
 
 
561 aa  340  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.74 
 
 
558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.34 
 
 
555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  37.72 
 
 
551 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  35.11 
 
 
568 aa  323  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  34.7 
 
 
559 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.38 
 
 
559 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.84 
 
 
592 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.92 
 
 
556 aa  316  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 
558 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.62 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  34.54 
 
 
552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  37.55 
 
 
560 aa  312  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  35.41 
 
 
582 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  33.72 
 
 
557 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  37.55 
 
 
558 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  36.27 
 
 
581 aa  309  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  33.53 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  34.24 
 
 
561 aa  306  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.58 
 
 
557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  37.45 
 
 
565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  37.45 
 
 
565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  36.46 
 
 
549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  36.36 
 
 
550 aa  303  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.89 
 
 
559 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  35.7 
 
 
584 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  33.45 
 
 
571 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  34.5 
 
 
578 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  35.48 
 
 
561 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  36.1 
 
 
581 aa  299  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  35.36 
 
 
585 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  32.74 
 
 
560 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  36.04 
 
 
555 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  34.3 
 
 
547 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.98 
 
 
584 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.62 
 
 
563 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  35.9 
 
 
582 aa  293  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  34.59 
 
 
545 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  33.03 
 
 
537 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.77 
 
 
571 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  33.85 
 
 
591 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  33.39 
 
 
537 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  34.43 
 
 
582 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  32.62 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.62 
 
 
549 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  33.68 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  32.81 
 
 
547 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.04 
 
 
547 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  33.14 
 
 
547 aa  283  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  32.88 
 
 
549 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.23 
 
 
542 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.38 
 
 
530 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  32.04 
 
 
559 aa  276  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.03 
 
 
549 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  33.18 
 
 
555 aa  276  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  31.97 
 
 
555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.74 
 
 
553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  32.06 
 
 
565 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  31.55 
 
 
556 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  31.57 
 
 
555 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  34.29 
 
 
555 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 
543 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  36.94 
 
 
567 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  32.56 
 
 
559 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.34 
 
 
534 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  28.11 
 
 
547 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  31.73 
 
 
556 aa  267  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  33.15 
 
 
546 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  33.19 
 
 
541 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  36.9 
 
 
569 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 
586 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.89 
 
 
546 aa  266  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>