More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3956 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 552 aa  1091    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  51.39 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  43.45 
 
 		 550 aa  395  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  34.91 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.42 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  39.04 
 
 		 562 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  38.6 
 
 		 599 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.14 
 
 		 561 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.68 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.85 
 
 		 558 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.45 
 
 		 560 aa  335  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  35.33 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  35.06 
 
 		 557 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.25 
 
 		 560 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.28 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.82 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.04 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.38 
 
 		 554 aa  326  9e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.7 
 
 		 558 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.86 
 
 		 557 aa  321  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  36.59 
 
 		 557 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  32.06 
 
 		 556 aa  319  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.09 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.2 
 
 		 561 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.1 
 
 		 559 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.67 
 
 		 573 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  38.2 
 
 		 582 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.33 
 
 		 549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.08 
 
 		 559 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  37.36 
 
 		 581 aa  303  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.92 
 
 		 592 aa  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.15 
 
 		 555 aa  302  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  38.25 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.9 
 
 		 558 aa  300  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  39.02 
 
 		 558 aa  299  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.72 
 
 		 563 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  37.74 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.9 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.35 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  36.53 
 
 		 582 aa  291  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.92 
 
 		 559 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.85 
 
 		 584 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 		 543 aa  287  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  33.81 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 		 544 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  37.43 
 
 		 591 aa  286  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  33.4 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  33.27 
 
 		 571 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  35.97 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.95 
 
 		 563 aa  280  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  31.69 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  33.76 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  33.14 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.93 
 
 		 561 aa  272  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.25 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  32.8 
 
 		 549 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  34.48 
 
 		 544 aa  269  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  34.62 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.98 
 
 		 568 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.8 
 
 		 578 aa  266  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  33.13 
 
 		 560 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.43 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  35.12 
 
 		 557 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  35.12 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.7 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  32.6 
 
 		 571 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 567 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  32.84 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  31.71 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  31.98 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  32.52 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  31.95 
 
 		 561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.55 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.95 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  35.45 
 
 		 570 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  31.56 
 
 		 549 aa  253  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.66 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  32.04 
 
 		 572 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  34.61 
 
 		 689 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.42 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.42 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  33.68 
 
 		 666 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.07 
 
 		 525 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.07 
 
 		 525 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.55 
 
 		 559 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.56 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.85 
 
 		 547 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  33.7 
 
 		 542 aa  246  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.65 
 
 		 525 aa  246  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.32 
 
 		 525 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  34.03 
 
 		 659 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.84 
 
 		 585 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.46 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.86 
 
 		 537 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.06 
 
 		 501 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  32.92 
 
 		 553 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  33.5 
 
 		 592 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.46 
 
 		 552 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.53 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>