More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1693 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 565 aa  1137    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 565 aa  1137    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.78 
 
 		 559 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.63 
 
 		 559 aa  342  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  35.45 
 
 		 561 aa  337  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.87 
 
 		 559 aa  336  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  35.95 
 
 		 558 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.76 
 
 		 561 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  34.71 
 
 		 560 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.89 
 
 		 561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.45 
 
 		 558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  35.71 
 
 		 556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.1 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  33.13 
 
 		 537 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  32.93 
 
 		 537 aa  300  6e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.18 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.21 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.56 
 
 		 551 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.4 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.68 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  33.51 
 
 		 571 aa  293  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.84 
 
 		 563 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.66 
 
 		 561 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  33.67 
 
 		 564 aa  288  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.56 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.35 
 
 		 568 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.67 
 
 		 549 aa  287  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.61 
 
 		 559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.93 
 
 		 559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  32.49 
 
 		 559 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.27 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.64 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  38.05 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  34.95 
 
 		 565 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.42 
 
 		 584 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  33.13 
 
 		 547 aa  276  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.46 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34 
 
 		 599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  31.58 
 
 		 558 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  32.7 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  28.86 
 
 		 549 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.09 
 
 		 558 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  34.92 
 
 		 540 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.81 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.22 
 
 		 549 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  28.68 
 
 		 549 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.87 
 
 		 581 aa  269  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  36.16 
 
 		 544 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.86 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  36.44 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.35 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.45 
 
 		 573 aa  264  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.88 
 
 		 560 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  33.73 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  33.53 
 
 		 557 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.54 
 
 		 578 aa  263  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2681  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.74 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  31.53 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  31.87 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.7 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.82 
 
 		 561 aa  260  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 		 571 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.43 
 
 		 559 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  31.72 
 
 		 556 aa  257  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  33.91 
 
 		 557 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.26 
 
 		 557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.91 
 
 		 563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.86 
 
 		 547 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.57 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.82 
 
 		 585 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.06 
 
 		 542 aa  250  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  33.03 
 
 		 582 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.05 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.62 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.42 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.31 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  34.72 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  34.55 
 
 		 556 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.88 
 
 		 558 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  34.17 
 
 		 558 aa  246  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.69 
 
 		 561 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  32.39 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.69 
 
 		 584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.6 
 
 		 547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  33.84 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.69 
 
 		 534 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.17 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  28.96 
 
 		 547 aa  243  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.5 
 
 		 546 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  32.09 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  35.01 
 
 		 562 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  35.01 
 
 		 562 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  34.47 
 
 		 574 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.19 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 		 544 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  32.67 
 
 		 544 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  31.66 
 
 		 545 aa  236  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.99 
 
 		 525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>