More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1499 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2681  2-octaprenylphenol hydroxylase  68.77 
 
 
539 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1076    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3885  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.72 
 
 
532 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.92 
 
 
565 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.92 
 
 
565 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.5 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.8 
 
 
558 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.16 
 
 
559 aa  231  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.58 
 
 
563 aa  230  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  31.81 
 
 
558 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  28.45 
 
 
561 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  28.08 
 
 
564 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.39 
 
 
561 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.28 
 
 
561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  33.92 
 
 
556 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.31 
 
 
558 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.72 
 
 
557 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.7 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.61 
 
 
504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.92 
 
 
530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  32.13 
 
 
544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 
599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  33.55 
 
 
557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.42 
 
 
558 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.16 
 
 
537 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.94 
 
 
558 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.32 
 
 
556 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  31.09 
 
 
544 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  32.58 
 
 
560 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
560 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.3 
 
 
592 aa  211  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
509 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.96 
 
 
559 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.18 
 
 
560 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.72 
 
 
555 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  31.07 
 
 
559 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  35.47 
 
 
544 aa  204  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  33.95 
 
 
542 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  30.68 
 
 
543 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  27.89 
 
 
537 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  28.71 
 
 
552 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.06 
 
 
568 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  30.68 
 
 
543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  30.68 
 
 
556 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.66 
 
 
546 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.76 
 
 
525 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  25.27 
 
 
559 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  33.24 
 
 
562 aa  200  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  31.84 
 
 
581 aa  200  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.02 
 
 
506 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.04 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 
544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.79 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.95 
 
 
559 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  29.94 
 
 
550 aa  198  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.82 
 
 
551 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.57 
 
 
545 aa  197  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  25.05 
 
 
558 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.3 
 
 
556 aa  196  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.78 
 
 
543 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.2 
 
 
549 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.73 
 
 
549 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.1 
 
 
550 aa  196  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 
582 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.71 
 
 
547 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.46 
 
 
547 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.73 
 
 
549 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.02 
 
 
546 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.65 
 
 
549 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.98 
 
 
549 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.36 
 
 
559 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.82 
 
 
549 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  30.13 
 
 
525 aa  195  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.3 
 
 
549 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.42 
 
 
552 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.33 
 
 
546 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.47 
 
 
559 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.36 
 
 
552 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.33 
 
 
546 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.33 
 
 
546 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.49 
 
 
553 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.33 
 
 
546 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  27.04 
 
 
563 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.1 
 
 
553 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.35 
 
 
546 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.33 
 
 
546 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.86 
 
 
537 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.49 
 
 
549 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  28.8 
 
 
547 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.49 
 
 
549 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.29 
 
 
549 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.77 
 
 
533 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.77 
 
 
533 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>