More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0918 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
526 aa  1047    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  31.67 
 
 
561 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.48 
 
 
561 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.9 
 
 
561 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.73 
 
 
573 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.75 
 
 
559 aa  266  7e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.74 
 
 
549 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  33.25 
 
 
562 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.49 
 
 
554 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  29.94 
 
 
560 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  27.29 
 
 
558 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.85 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  29.21 
 
 
565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.08 
 
 
559 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.83 
 
 
558 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.59 
 
 
563 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 
558 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  29.58 
 
 
565 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  26.71 
 
 
557 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.35 
 
 
552 aa  247  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  31.74 
 
 
564 aa  248  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  27.29 
 
 
557 aa  246  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  27.68 
 
 
558 aa  246  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.45 
 
 
568 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  28.67 
 
 
558 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.46 
 
 
555 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  27.88 
 
 
561 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.12 
 
 
561 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  27.81 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  28.82 
 
 
606 aa  239  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.44 
 
 
578 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  30.69 
 
 
562 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  28.57 
 
 
563 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  27.4 
 
 
581 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  27.73 
 
 
585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  28.42 
 
 
582 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  33.33 
 
 
549 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  33.33 
 
 
549 aa  233  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  28.01 
 
 
556 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  26.65 
 
 
549 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  29.76 
 
 
559 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  26.1 
 
 
549 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  31.34 
 
 
544 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  26.1 
 
 
549 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  27.63 
 
 
581 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  29.37 
 
 
560 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.04 
 
 
558 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.37 
 
 
547 aa  228  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  27.81 
 
 
549 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  28.87 
 
 
557 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  27.03 
 
 
561 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30 
 
 
525 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  30.49 
 
 
544 aa  226  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.3 
 
 
559 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  27.03 
 
 
584 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  34.89 
 
 
567 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  30 
 
 
556 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  29.72 
 
 
571 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  28.29 
 
 
599 aa  223  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.34 
 
 
525 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.85 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.34 
 
 
525 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.79 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  27.84 
 
 
566 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.43 
 
 
521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.44 
 
 
522 aa  220  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.89 
 
 
525 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  29.61 
 
 
560 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  29.23 
 
 
583 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  27.8 
 
 
582 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  27.8 
 
 
582 aa  219  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.65 
 
 
525 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.65 
 
 
525 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.65 
 
 
525 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.94 
 
 
525 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.28 
 
 
584 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  26.45 
 
 
582 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.53 
 
 
559 aa  219  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  30.42 
 
 
586 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.51 
 
 
544 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  25.67 
 
 
547 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.4 
 
 
558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  27.43 
 
 
610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  27.43 
 
 
588 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.39 
 
 
619 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  29.45 
 
 
543 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  29.69 
 
 
525 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.86 
 
 
561 aa  217  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  35.83 
 
 
659 aa  216  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  30.57 
 
 
550 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.47 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  28.11 
 
 
553 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  29 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  30.73 
 
 
527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>