More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1656 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  1004    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  80.29 
 
 
483 aa  789    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  57.98 
 
 
475 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  58.87 
 
 
473 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29.91 
 
 
438 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  35.06 
 
 
480 aa  193  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.6 
 
 
440 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.44 
 
 
441 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  26.83 
 
 
433 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  26.53 
 
 
434 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  31.47 
 
 
438 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  35.67 
 
 
434 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  31.72 
 
 
452 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.13 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.21 
 
 
466 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  30.8 
 
 
469 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  33.23 
 
 
433 aa  158  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.45 
 
 
440 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  28.47 
 
 
443 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  33.23 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  32.79 
 
 
481 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  37.82 
 
 
582 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  35.05 
 
 
447 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  33.23 
 
 
448 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  29.49 
 
 
457 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  35.04 
 
 
470 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  30.62 
 
 
477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  30.73 
 
 
454 aa  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.53 
 
 
558 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  34.17 
 
 
461 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  31.8 
 
 
562 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  35.05 
 
 
445 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  30.89 
 
 
432 aa  150  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  36.33 
 
 
543 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 
436 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.13 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 
549 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.08 
 
 
559 aa  148  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  32.37 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  28.9 
 
 
454 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  31.23 
 
 
564 aa  146  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  35.07 
 
 
574 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  34.63 
 
 
453 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.93 
 
 
551 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30.14 
 
 
549 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  32.29 
 
 
571 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.67 
 
 
448 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  32.54 
 
 
453 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  30.05 
 
 
437 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  31.14 
 
 
476 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.18 
 
 
585 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  34.01 
 
 
563 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.9 
 
 
559 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.54 
 
 
549 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  36.84 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  32.23 
 
 
670 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.79 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  35.74 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  33.45 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  33.45 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  38.49 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  32.88 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  29.38 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  37.7 
 
 
557 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.41 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  33.21 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  33.12 
 
 
450 aa  140  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  30.16 
 
 
514 aa  140  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  28.54 
 
 
629 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  32.45 
 
 
619 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  35.83 
 
 
583 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  33.79 
 
 
438 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  31.75 
 
 
619 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  31.02 
 
 
562 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.77 
 
 
455 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  25.98 
 
 
440 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  27.86 
 
 
767 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.45 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 
689 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  31.58 
 
 
445 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.21 
 
 
555 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  29.19 
 
 
558 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  33.93 
 
 
566 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  34.4 
 
 
452 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.81 
 
 
554 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  35.63 
 
 
545 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  31.39 
 
 
619 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  32.23 
 
 
445 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.73 
 
 
573 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  32.76 
 
 
545 aa  136  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  31.23 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  31.23 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32 
 
 
558 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  32.92 
 
 
576 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  34.14 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  33.98 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  33.46 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  31.91 
 
 
659 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>