More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0964 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  883    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  59.46 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  57.56 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  57.79 
 
 		 437 aa  494  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  58.11 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  56.79 
 
 		 455 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  56.18 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  54.65 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  56.53 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  54.2 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  58.2 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  54.63 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  51.58 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  51.13 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  49.21 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  44.27 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  43.69 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  44.42 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  44.87 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  48.85 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  44.42 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  42.57 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  43.15 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.97 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  35.04 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  36.62 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  33.42 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  35.16 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  35.32 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.74 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  34.44 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  33.43 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  29.64 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  35.61 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  36.95 
 
 		 485 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  30.77 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  32.42 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.55 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.24 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  30.2 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  34.43 
 
 		 629 aa  147  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  33.16 
 
 		 454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.56 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  36.5 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.49 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  33.11 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  27.85 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.79 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  32.23 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  35.4 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  33.11 
 
 		 455 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  36.19 
 
 		 767 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  29.98 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  33.01 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  32.45 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.7 
 
 		 557 aa  136  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.86 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  29.76 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  33.12 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  34.63 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.86 
 
 		 558 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  31.09 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  32.83 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  33.22 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  25.93 
 
 		 440 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  34.8 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  32.89 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.68 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  35.19 
 
 		 550 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  29.15 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  26.53 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  30.45 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  27.48 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  34 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.15 
 
 		 565 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.15 
 
 		 565 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  27.53 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  27.52 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  31.1 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  27.41 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  33.6 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  29.15 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.5 
 
 		 559 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  29.47 
 
 		 541 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09851  kinase  31.38 
 
 		 564 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  29.35 
 
 		 618 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  29.02 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.22 
 
 		 568 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.7 
 
 		 555 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  29.53 
 
 		 618 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.5 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  35.29 
 
 		 619 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  28.87 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>