More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0987 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  100 
 
 		 438 aa  915    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  63.08 
 
 		 441 aa  604  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  61.68 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  56.38 
 
 		 433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  55.92 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  54.29 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  30.04 
 
 		 480 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.07 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  33.25 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  29.58 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  30.19 
 
 		 483 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  29.4 
 
 		 574 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  32.28 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.14 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  29.53 
 
 		 543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  29.04 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  26.39 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  27.7 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  28.07 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  27.13 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  26.82 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  27.4 
 
 		 454 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  26.88 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  28.76 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  27.71 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  26.91 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  26.71 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  27.09 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  31.02 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  28.24 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  29.74 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  29.45 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  30.21 
 
 		 564 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  29.45 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  29.79 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  26.48 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  26.87 
 
 		 476 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  27.4 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  29.19 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  26.46 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  29.15 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  29.32 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  26.09 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  27.05 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  27.06 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  25.75 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  27.06 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  26.83 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  28.67 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  25.24 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.04 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  27.8 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  24.03 
 
 		 455 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  29.79 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  30.45 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  27.85 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  25.86 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  26.9 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  27.36 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  29.58 
 
 		 616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  26.82 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  28.85 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  24.32 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  27.05 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  24.1 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  26.52 
 
 		 562 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  27.24 
 
 		 576 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  25.77 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.45 
 
 		 619 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  24.89 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  24.89 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.39 
 
 		 689 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  27.03 
 
 		 629 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  25.57 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  28.29 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2319  protein kinase  28.75 
 
 		 620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.919005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  23.96 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  24.27 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2693  protein kinase  28.43 
 
 		 619 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  28 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  26.24 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  26.52 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  30.45 
 
 		 588 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  25.23 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  24.04 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.93 
 
 		 559 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  30.14 
 
 		 666 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  28.94 
 
 		 578 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  27.75 
 
 		 618 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  25.17 
 
 		 441 aa  123  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  30.59 
 
 		 582 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  28.15 
 
 		 557 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  27.88 
 
 		 557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  29.66 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  27.18 
 
 		 618 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  26.79 
 
 		 618 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  24.58 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>