More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1924 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 441 aa  913    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  63.08 
 
 		 438 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  63.26 
 
 		 440 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  52.79 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  50.93 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  53.05 
 
 		 440 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  28.91 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  30.39 
 
 		 473 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  28.83 
 
 		 475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  28.57 
 
 		 485 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  28.01 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  28.37 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.13 
 
 		 574 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.32 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  29.97 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  28.34 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  30.47 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  27.33 
 
 		 448 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  27.1 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.06 
 
 		 437 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  27.7 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  31.27 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.94 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  31.67 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  31.63 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  30.79 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.11 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.18 
 
 		 440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  28.68 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  29.33 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  26.67 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  26.67 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  28.84 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  29.38 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  32.2 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  28 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  29.27 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  27.44 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  28.6 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  28.94 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.67 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  28.95 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  27.73 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  27.73 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  28.21 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  28.81 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.5 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  27.53 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  29.49 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  29.87 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  29.68 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  28.09 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  25.81 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  25.35 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  24.14 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.82 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  26.09 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  28.73 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.17 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.58 
 
 		 452 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  27.98 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  24.19 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.13 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  28.77 
 
 		 564 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  29.37 
 
 		 616 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  26.87 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  24.89 
 
 		 457 aa  126  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  26.7 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  26.56 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  26.8 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  28.68 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  28.11 
 
 		 576 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  26.89 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  29.63 
 
 		 619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  28.78 
 
 		 550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  29.67 
 
 		 689 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  32.49 
 
 		 588 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  26.23 
 
 		 432 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  25.45 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  30.91 
 
 		 610 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  28.15 
 
 		 619 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  28.24 
 
 		 665 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  28.24 
 
 		 665 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.01 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  27.51 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  30.95 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  27.72 
 
 		 659 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  28.15 
 
 		 619 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  26.79 
 
 		 767 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  29.26 
 
 		 549 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  27.8 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  26.2 
 
 		 560 aa  113  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  28.85 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28.06 
 
 		 558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  29.37 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  30 
 
 		 583 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>