More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80246 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  100 
 
 
560 aa  1167    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  55.77 
 
 
767 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  48.29 
 
 
629 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  39.96 
 
 
480 aa  324  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  38.57 
 
 
464 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  38.28 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  38.05 
 
 
451 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  37.11 
 
 
466 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  37.64 
 
 
440 aa  279  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  36.95 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  38.1 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  38.17 
 
 
441 aa  269  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  36.99 
 
 
440 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  34.4 
 
 
440 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  36.01 
 
 
432 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  35.85 
 
 
446 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  36.03 
 
 
457 aa  264  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  37.73 
 
 
457 aa  263  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  36.61 
 
 
440 aa  260  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  34.26 
 
 
455 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  26.73 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  26.91 
 
 
486 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.19 
 
 
432 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  32.17 
 
 
481 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  31.91 
 
 
476 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.26 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  28.75 
 
 
495 aa  135  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  28.92 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  28.7 
 
 
445 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  28.25 
 
 
495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  27.75 
 
 
437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  27.79 
 
 
462 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  27.83 
 
 
447 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  30.56 
 
 
433 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  28.8 
 
 
453 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  27.15 
 
 
447 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  29.77 
 
 
443 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  26.41 
 
 
445 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  28.29 
 
 
445 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  26.19 
 
 
445 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  26.19 
 
 
445 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  26.73 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  27.77 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  26.95 
 
 
473 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  28.12 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  26.7 
 
 
438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  30.79 
 
 
438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
436 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  26.36 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  34.51 
 
 
556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  27.38 
 
 
453 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  27.89 
 
 
461 aa  120  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  27.01 
 
 
456 aa  120  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  27.01 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  28.24 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  27.33 
 
 
445 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  27.3 
 
 
456 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  27.41 
 
 
445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  30.07 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  27.59 
 
 
455 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  28.29 
 
 
483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  29.89 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  29.68 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  26.74 
 
 
454 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  26.2 
 
 
441 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  25.25 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  28.45 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  30.26 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  26.8 
 
 
434 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  27.09 
 
 
453 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  28.34 
 
 
440 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  28.48 
 
 
565 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
475 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  27.86 
 
 
454 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  29.58 
 
 
477 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  27.11 
 
 
455 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  29.17 
 
 
499 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  26.83 
 
 
448 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  27.92 
 
 
456 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25.38 
 
 
480 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  29.62 
 
 
552 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  27.15 
 
 
458 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  30.66 
 
 
470 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  26.1 
 
 
558 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.62 
 
 
559 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  27.14 
 
 
440 aa  100  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3828  hypothetical protein  35.92 
 
 
591 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  23.48 
 
 
438 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  26.18 
 
 
433 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  26.81 
 
 
440 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.04 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.62 
 
 
549 aa  96.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  31.82 
 
 
556 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.67 
 
 
564 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.33 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  30.57 
 
 
560 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  30.2 
 
 
588 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  27.82 
 
 
576 aa  93.6  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>