More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9634 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  100 
 
 
480 aa  1001    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  42.52 
 
 
629 aa  359  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  40.84 
 
 
767 aa  358  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  39.96 
 
 
560 aa  324  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  33.48 
 
 
432 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  34.2 
 
 
451 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.98 
 
 
451 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  33.63 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  34.66 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  33.48 
 
 
464 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  33.99 
 
 
454 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  33.77 
 
 
469 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  33.04 
 
 
440 aa  236  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  33.55 
 
 
446 aa  230  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  32.1 
 
 
440 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.3 
 
 
457 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.11 
 
 
440 aa  223  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  30.24 
 
 
455 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  32.1 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  32.67 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.48 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  27.92 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  27.27 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  27.57 
 
 
486 aa  162  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  28.63 
 
 
434 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  27.61 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  27.2 
 
 
480 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  27.02 
 
 
448 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
481 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  26.42 
 
 
499 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.36 
 
 
433 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.24 
 
 
438 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  29.8 
 
 
455 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.73 
 
 
434 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  27.89 
 
 
438 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  26.46 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  31.27 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  28.42 
 
 
462 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  30.21 
 
 
440 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  29.02 
 
 
445 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  28.44 
 
 
473 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  28.43 
 
 
483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  26.93 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  27.49 
 
 
475 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  27.92 
 
 
437 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  26.35 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  29.47 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  25.44 
 
 
485 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  26.97 
 
 
453 aa  110  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  27.51 
 
 
445 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  29.01 
 
 
445 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  27.3 
 
 
440 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  29.01 
 
 
445 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  28.54 
 
 
557 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  30.63 
 
 
470 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  29.46 
 
 
447 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  29.7 
 
 
565 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  29.7 
 
 
565 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30.72 
 
 
448 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  25.87 
 
 
454 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.31 
 
 
448 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  26.45 
 
 
441 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  25.47 
 
 
543 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  28.74 
 
 
445 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  24.89 
 
 
436 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  28.4 
 
 
450 aa  103  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  25.87 
 
 
454 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  24.72 
 
 
473 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.14 
 
 
556 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  25.75 
 
 
562 aa  99.8  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  26.76 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  24.88 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.51 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  26.19 
 
 
559 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  25.11 
 
 
574 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  27.3 
 
 
451 aa  97.8  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  29.14 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  27.86 
 
 
445 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  23.6 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12044  predicted protein  29.29 
 
 
266 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  25.78 
 
 
558 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  26.61 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  21.7 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  27.1 
 
 
560 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.96 
 
 
568 aa  94.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  22.83 
 
 
558 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  26.82 
 
 
576 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2198  ABC1 family protein  26.61 
 
 
648 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  27.3 
 
 
547 aa  94  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16827  predicted protein  28.98 
 
 
475 aa  94  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3188  ABC1 family protein  27.11 
 
 
648 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  27.18 
 
 
458 aa  93.6  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2127  ABC1 family protein  27.11 
 
 
648 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  28.43 
 
 
582 aa  93.6  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.36 
 
 
555 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  24.56 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1231  predicted protein  25.64 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  25.83 
 
 
525 aa  92  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  31.18 
 
 
556 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2150  ABC1 family protein  26.07 
 
 
648 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>