More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1130 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  905    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  69.61 
 
 
454 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  65.57 
 
 
432 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  56.91 
 
 
466 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  56.68 
 
 
469 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  54.3 
 
 
451 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  54.44 
 
 
451 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  53.69 
 
 
464 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  53.15 
 
 
440 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  49.45 
 
 
455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  51.61 
 
 
440 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  51.87 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  51.4 
 
 
440 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  48.52 
 
 
441 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  48.97 
 
 
457 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  42.53 
 
 
457 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  38.41 
 
 
767 aa  280  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  35.85 
 
 
560 aa  264  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  36.68 
 
 
629 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  33.55 
 
 
480 aa  230  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.78 
 
 
468 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  30.94 
 
 
486 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  27.61 
 
 
434 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  29.19 
 
 
495 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  30.82 
 
 
453 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  30.56 
 
 
455 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  34.05 
 
 
473 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.34 
 
 
441 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.37 
 
 
437 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 
456 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  28.07 
 
 
495 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  27.55 
 
 
432 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  31.25 
 
 
456 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  27.85 
 
 
461 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  35.26 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  30.97 
 
 
456 aa  153  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.04 
 
 
543 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  28.61 
 
 
470 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  30.58 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
447 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  32.29 
 
 
451 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.24 
 
 
452 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  26.27 
 
 
433 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  34.65 
 
 
445 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  29.83 
 
 
453 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.09 
 
 
438 aa  143  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  25.29 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  31.22 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  29.64 
 
 
453 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  30.04 
 
 
443 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.7 
 
 
440 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.05 
 
 
448 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  28.04 
 
 
454 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  31.55 
 
 
574 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  32.59 
 
 
438 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  29.56 
 
 
445 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  31.13 
 
 
455 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  28.86 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30.08 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  29.38 
 
 
456 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.06 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.82 
 
 
438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  29.13 
 
 
452 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  32.59 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  30.93 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  28.28 
 
 
473 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  27.94 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  28.5 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.59 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  28.24 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  29.97 
 
 
462 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  29.32 
 
 
454 aa  123  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  27.6 
 
 
445 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  27.52 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  24.95 
 
 
440 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  25.75 
 
 
445 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  28.7 
 
 
445 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  28.7 
 
 
445 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  29.28 
 
 
588 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.65 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  27.95 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  28.24 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  31.3 
 
 
606 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 
556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.41 
 
 
525 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  29.45 
 
 
499 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  28.57 
 
 
448 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  26.07 
 
 
558 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  25.78 
 
 
562 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.28 
 
 
433 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.27 
 
 
565 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  33.2 
 
 
556 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  25.26 
 
 
458 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  28.14 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.55 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  27.91 
 
 
610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.24 
 
 
563 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.71 
 
 
509 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  27.08 
 
 
582 aa  107  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>