More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0170 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  92.35 
 
 		 610 aa  1051    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  56.9 
 
 		 613 aa  666    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1175    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  44.42 
 
 		 562 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  37.99 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  36.17 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  33.4 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.82 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.93 
 
 		 585 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  34.15 
 
 		 582 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  31.73 
 
 		 561 aa  276  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.4 
 
 		 563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.17 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.99 
 
 		 584 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  32.19 
 
 		 561 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 580 aa  260  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  32.01 
 
 		 564 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.67 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  35.14 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.55 
 
 		 561 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.09 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  31.74 
 
 		 557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.16 
 
 		 559 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  31.58 
 
 		 555 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  31.03 
 
 		 559 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  33.63 
 
 		 566 aa  243  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.4 
 
 		 558 aa  241  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  34.63 
 
 		 550 aa  241  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.74 
 
 		 561 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.51 
 
 		 559 aa  241  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  33.2 
 
 		 560 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  29.6 
 
 		 561 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.36 
 
 		 563 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  31.25 
 
 		 555 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.4 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.69 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  29.01 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  31.03 
 
 		 541 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.11 
 
 		 558 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  33.95 
 
 		 559 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  30.68 
 
 		 555 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.02 
 
 		 552 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  33.13 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  28.95 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.48 
 
 		 549 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.89 
 
 		 547 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  31.78 
 
 		 567 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.48 
 
 		 558 aa  230  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.66 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  34.08 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.32 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  30 
 
 		 562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  30 
 
 		 562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  28.76 
 
 		 549 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.9 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  29.41 
 
 		 560 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  30.81 
 
 		 562 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  32.35 
 
 		 583 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  30.89 
 
 		 569 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.59 
 
 		 557 aa  223  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  29.29 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  32.22 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.35 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  32.15 
 
 		 544 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  28.77 
 
 		 551 aa  220  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.95 
 
 		 559 aa  220  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.74 
 
 		 558 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  29.82 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.18 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  28.38 
 
 		 547 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.36 
 
 		 573 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  31.7 
 
 		 574 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 		 526 aa  217  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.62 
 
 		 560 aa  217  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  31.34 
 
 		 545 aa  217  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  30.89 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  30.29 
 
 		 660 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3101  ABC-1 domain protein  31.81 
 
 		 564 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.91 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  28.93 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  32.3 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.91 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  30.69 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  30.56 
 
 		 670 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.42 
 
 		 592 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  32.13 
 
 		 689 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.77 
 
 		 550 aa  213  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  30.19 
 
 		 559 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  29.46 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.51 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  28.82 
 
 		 560 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.82 
 
 		 555 aa  211  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  32.23 
 
 		 572 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.19 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  31.98 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.83 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  30.79 
 
 		 665 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  26.95 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>