More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1003 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1003  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1168    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  32.51 
 
 
613 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  32.81 
 
 
570 aa  279  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  34.26 
 
 
610 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  33.52 
 
 
588 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  32.71 
 
 
562 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  30.83 
 
 
576 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  29.84 
 
 
562 aa  256  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  30.28 
 
 
578 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
571 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  29.3 
 
 
561 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.8 
 
 
563 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 
585 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.19 
 
 
557 aa  216  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.55 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 
561 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  27.97 
 
 
560 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  26.85 
 
 
562 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  26.85 
 
 
562 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  26.37 
 
 
558 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.36 
 
 
554 aa  209  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  29.53 
 
 
541 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  26.34 
 
 
559 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  28.48 
 
 
556 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  27.93 
 
 
559 aa  203  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  30.42 
 
 
560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  30.93 
 
 
665 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  30.93 
 
 
665 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  28.24 
 
 
558 aa  200  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  29.41 
 
 
560 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.9 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  27.62 
 
 
555 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  31.17 
 
 
670 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  29.26 
 
 
567 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.02 
 
 
561 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  30.36 
 
 
552 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  27.81 
 
 
555 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.9 
 
 
689 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.47 
 
 
561 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  27.97 
 
 
557 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.17 
 
 
550 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  27.62 
 
 
555 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  27.32 
 
 
555 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  29.8 
 
 
557 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.85 
 
 
559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  28.76 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3296  hypothetical protein  30.59 
 
 
684 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  30.77 
 
 
558 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  40.23 
 
 
556 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  32.08 
 
 
559 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  28.09 
 
 
572 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  28.9 
 
 
660 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  26.63 
 
 
558 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  29.21 
 
 
544 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.64 
 
 
561 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.98 
 
 
573 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  28.71 
 
 
619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.94 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  30.92 
 
 
559 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  27.64 
 
 
563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  30.62 
 
 
629 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  30.44 
 
 
550 aa  183  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  24.45 
 
 
558 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  28 
 
 
578 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  28.11 
 
 
551 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  30.95 
 
 
652 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.93 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  26.5 
 
 
560 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  24.66 
 
 
561 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  26.1 
 
 
556 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  27.4 
 
 
618 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  27.83 
 
 
640 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.29 
 
 
558 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.29 
 
 
592 aa  179  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.54 
 
 
553 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  26.31 
 
 
560 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  27.71 
 
 
568 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.92 
 
 
547 aa  177  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.45 
 
 
559 aa  176  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 
581 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  28.6 
 
 
592 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.75 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.78 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  27.04 
 
 
559 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  27.98 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  27.87 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  31.38 
 
 
542 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  27.64 
 
 
565 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  27.64 
 
 
565 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  27.26 
 
 
562 aa  173  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.67 
 
 
537 aa  173  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  29.33 
 
 
659 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  28.19 
 
 
566 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  29.14 
 
 
619 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.93 
 
 
666 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.32 
 
 
519 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  28.86 
 
 
560 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  24.76 
 
 
552 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  29.38 
 
 
582 aa  171  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>