More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0211 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  73.27 
 
 		 470 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 453 aa  916    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  82.34 
 
 		 456 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  81.42 
 
 		 456 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  82.34 
 
 		 456 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  90.93 
 
 		 455 aa  819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  81.64 
 
 		 453 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  67.33 
 
 		 453 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  69.01 
 
 		 456 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  63.11 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  58.84 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  56.82 
 
 		 452 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  51.59 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  49.66 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.85 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.67 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.45 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.95 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.02 
 
 		 574 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  32.39 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  27.87 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.3 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  34.06 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  32.74 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  33.75 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  29.86 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29.79 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.75 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  30.07 
 
 		 440 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.48 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  32.28 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  29.97 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  32.56 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  32.56 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  32.56 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  27.45 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  34.78 
 
 		 436 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  32.56 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.55 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  29.32 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.66 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.64 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  29.15 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  31.41 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.42 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  28.36 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  30.24 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  31.29 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  29.95 
 
 		 454 aa  146  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.09 
 
 		 441 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  31.76 
 
 		 576 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.2 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  34.55 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  28.95 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.12 
 
 		 549 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  31.67 
 
 		 588 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  28.33 
 
 		 480 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  28.54 
 
 		 499 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.08 
 
 		 564 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  28.52 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  28.38 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.67 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.65 
 
 		 558 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  34.44 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  27.46 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  29.41 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.9 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.44 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  32.48 
 
 		 556 aa  136  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.46 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  27.71 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.9 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  29.77 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  27.94 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  29.63 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.81 
 
 		 440 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  27.18 
 
 		 558 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  23.4 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  31.88 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 		 583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  34.63 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  30.72 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.75 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  32.27 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  27.13 
 
 		 659 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  35.16 
 
 		 557 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  29.97 
 
 		 610 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  31.76 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.68 
 
 		 557 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  32.2 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.83 
 
 		 557 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  25.66 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.15 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  28.03 
 
 		 578 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>