More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0457 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  91.37 
 
 		 473 aa  902    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 475 aa  979    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  60.55 
 
 		 483 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  57.98 
 
 		 485 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  33.25 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  33.55 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.83 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.63 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.74 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.46 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.77 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  31.42 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  30.13 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  29.88 
 
 		 440 aa  171  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  28.87 
 
 		 434 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  31.81 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  37.74 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  29.33 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  32.9 
 
 		 481 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  29.97 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  33.02 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.08 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  30.73 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.9 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  37.35 
 
 		 461 aa  153  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  28.87 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  31.9 
 
 		 582 aa  149  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  28.86 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 		 454 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  35.93 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.31 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  33.57 
 
 		 563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  30.1 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  34.33 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  34.01 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  34.21 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  33.02 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  31.82 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  34.91 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.23 
 
 		 558 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  31.49 
 
 		 584 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  36.13 
 
 		 445 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.89 
 
 		 440 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.13 
 
 		 585 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  31.63 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  29.41 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  36.14 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.54 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  33.82 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.35 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.77 
 
 		 561 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  34.54 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  36.26 
 
 		 543 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 		 564 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  33.87 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  34.14 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  28.54 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  31.92 
 
 		 443 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.07 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.82 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  33.71 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  34.56 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  34.33 
 
 		 452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 		 450 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  34.56 
 
 		 499 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  32.86 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  27.88 
 
 		 767 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  28.66 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.22 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.06 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  35.48 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  34.66 
 
 		 453 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.94 
 
 		 554 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  33.69 
 
 		 574 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.09 
 
 		 445 aa  133  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  29.57 
 
 		 552 aa  133  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  32.95 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  32.51 
 
 		 689 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  32.72 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  32.72 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.8 
 
 		 559 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  32.85 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.07 
 
 		 573 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  32.44 
 
 		 556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  35.74 
 
 		 660 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  35.4 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  32.44 
 
 		 666 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  34.73 
 
 		 566 aa  130  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  26.33 
 
 		 455 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  34.53 
 
 		 619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1159  hypothetical protein  31.02 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152108 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  31.84 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  30.71 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  30.94 
 
 		 618 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  30.71 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>