More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0328 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  100 
 
 
454 aa  918    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  67.77 
 
 
452 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  56.67 
 
 
452 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  54.25 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  53.32 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  50 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  50.11 
 
 
453 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  49.66 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  49.43 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  49.1 
 
 
456 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  48.08 
 
 
456 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  48.42 
 
 
456 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  48.42 
 
 
456 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  47.84 
 
 
453 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  32.05 
 
 
434 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  37.42 
 
 
448 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  36.1 
 
 
543 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.85 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  31.21 
 
 
448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  34.82 
 
 
437 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  36.05 
 
 
574 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.24 
 
 
432 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.62 
 
 
433 aa  159  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  29.34 
 
 
447 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  30.5 
 
 
448 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  29.26 
 
 
458 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.23 
 
 
455 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  27.4 
 
 
438 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  35 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  36.69 
 
 
483 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  29.45 
 
 
480 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  33.55 
 
 
438 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  35.62 
 
 
436 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  32.8 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  29.67 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  37.23 
 
 
440 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.98 
 
 
440 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  31.54 
 
 
443 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  31.03 
 
 
438 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.73 
 
 
485 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  34.05 
 
 
451 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  31.85 
 
 
445 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  30.17 
 
 
499 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.55 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  35.47 
 
 
473 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  34.23 
 
 
445 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.79 
 
 
441 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  34.23 
 
 
445 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  33.42 
 
 
556 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  34.23 
 
 
445 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.14 
 
 
558 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 
477 aa  143  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  32.22 
 
 
470 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.62 
 
 
565 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.06 
 
 
440 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  32.68 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.35 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  35.59 
 
 
566 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  26.02 
 
 
433 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  28.04 
 
 
446 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  30.95 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
583 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.64 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  27.95 
 
 
432 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 
563 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  28.94 
 
 
574 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.45 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  29.59 
 
 
476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  33.45 
 
 
451 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  29.76 
 
 
445 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  28.5 
 
 
599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  32.84 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.48 
 
 
555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.01 
 
 
549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  32.86 
 
 
454 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 
576 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.13 
 
 
468 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  29.84 
 
 
557 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.95 
 
 
464 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  29.75 
 
 
640 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  25.88 
 
 
556 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  28.93 
 
 
481 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.82 
 
 
434 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  32.31 
 
 
557 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.8 
 
 
558 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  32.69 
 
 
517 aa  123  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  33.21 
 
 
556 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  26.71 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 
549 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  33.71 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.2 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.25 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.1 
 
 
557 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  32.73 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  28 
 
 
455 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  33.81 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 
553 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>