More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3756 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  75.72 
 
 
574 aa  805    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  100 
 
 
563 aa  1134    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  41.53 
 
 
556 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  39.21 
 
 
565 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  40.07 
 
 
556 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.65 
 
 
558 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.49 
 
 
563 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.15 
 
 
549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 
557 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.03 
 
 
554 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.82 
 
 
561 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.75 
 
 
559 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.33 
 
 
565 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.6 
 
 
559 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.33 
 
 
565 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.1 
 
 
556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 
558 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.08 
 
 
558 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  30.43 
 
 
559 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  32.72 
 
 
562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  29.5 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.92 
 
 
501 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  29.52 
 
 
549 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.02 
 
 
561 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.76 
 
 
557 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.84 
 
 
552 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  27.06 
 
 
564 aa  232  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  29.14 
 
 
565 aa  230  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.76 
 
 
549 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.5 
 
 
530 aa  229  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  27.73 
 
 
558 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  29.81 
 
 
581 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.87 
 
 
549 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.94 
 
 
599 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  29.87 
 
 
549 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  30.39 
 
 
578 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  29.05 
 
 
561 aa  226  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  28.68 
 
 
547 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  26.58 
 
 
561 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  29.38 
 
 
585 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  29.85 
 
 
581 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.94 
 
 
555 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  28.75 
 
 
571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.13 
 
 
563 aa  220  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.09 
 
 
537 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.34 
 
 
573 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.49 
 
 
559 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  28.31 
 
 
560 aa  217  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.08 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 
526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  30.95 
 
 
550 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  29.73 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.32 
 
 
556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.57 
 
 
560 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.85 
 
 
547 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  29.27 
 
 
584 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  29.27 
 
 
561 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  28.76 
 
 
571 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  27.49 
 
 
537 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  29.57 
 
 
582 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.02 
 
 
592 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.66 
 
 
568 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  30.26 
 
 
582 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.29 
 
 
514 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.83 
 
 
559 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  30.67 
 
 
545 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.95 
 
 
559 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.83 
 
 
558 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  28.87 
 
 
547 aa  206  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  28.63 
 
 
560 aa  206  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  26.37 
 
 
558 aa  206  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  28.29 
 
 
606 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.64 
 
 
561 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  28.82 
 
 
582 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  28.49 
 
 
550 aa  206  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  26.45 
 
 
586 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.85 
 
 
547 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  31.16 
 
 
557 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  30.21 
 
 
553 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  27.33 
 
 
562 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  27.33 
 
 
562 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  29.28 
 
 
551 aa  202  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.92 
 
 
559 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.26 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  30.56 
 
 
582 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.36 
 
 
557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.09 
 
 
557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  29.01 
 
 
591 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.18 
 
 
542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  28.62 
 
 
551 aa  200  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.29 
 
 
546 aa  199  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  30.98 
 
 
544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  29.79 
 
 
652 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  28.82 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.08 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.56 
 
 
522 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  27.95 
 
 
552 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.66 
 
 
558 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  29.43 
 
 
555 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.01 
 
 
525 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>