More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4322 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  933    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  91.83 
 
 		 469 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  63.8 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  64.58 
 
 		 451 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  64.58 
 
 		 451 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  56.91 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  57.41 
 
 		 432 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  59.68 
 
 		 440 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  56.55 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  49.42 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  52.98 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  51.99 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  46.1 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  46.85 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  47.32 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  47.38 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  37.33 
 
 		 629 aa  289  6e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  35.94 
 
 		 767 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  37.11 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  34.66 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  30.97 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.86 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.86 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  32.08 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.56 
 
 		 455 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.22 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.22 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  34.12 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  35.47 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  33.13 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  28.41 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  33.64 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.1 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  32.75 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  28.41 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  31.74 
 
 		 543 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  30.93 
 
 		 499 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  30.25 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.59 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  31.65 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  31.5 
 
 		 574 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  31.03 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  29.56 
 
 		 473 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  30.5 
 
 		 445 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  34.22 
 
 		 456 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  31.76 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  29.45 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  32.59 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.12 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  29.68 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  30.73 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  33.08 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  33.08 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  31.49 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.79 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  31.46 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  32.03 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.1 
 
 		 438 aa  143  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  28.87 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.99 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.64 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  32.68 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  26.43 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  35.61 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  31.33 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  25.35 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  28.97 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.32 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  31.37 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  31.44 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  29.91 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  29.91 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  29.33 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.74 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.11 
 
 		 559 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  28.02 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  27.87 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 		 450 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  29.69 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  23.46 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.17 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  27.56 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  23.06 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  23.79 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.47 
 
 		 550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.44 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3134  aminotransferase class-III  34.38 
 
 		 875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  25.89 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  33.45 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.52 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  27.13 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 		 556 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  29.97 
 
 		 599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.13 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.4 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.89 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 		 557 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>