More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5542 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  974    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  62.34 
 
 
473 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  51.19 
 
 
477 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  37.43 
 
 
462 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  35.24 
 
 
448 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  33.87 
 
 
436 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.66 
 
 
574 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  35.24 
 
 
543 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  31.87 
 
 
445 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  35.07 
 
 
440 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  31.65 
 
 
445 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  31.65 
 
 
445 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.68 
 
 
450 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  34.95 
 
 
448 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  33.03 
 
 
443 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  34.25 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  30.85 
 
 
447 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  31.85 
 
 
455 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  33.18 
 
 
437 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30.26 
 
 
445 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  35.75 
 
 
434 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 
438 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  33.63 
 
 
499 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  31.15 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  35.83 
 
 
470 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  33.03 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  38.83 
 
 
481 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  30.54 
 
 
438 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  34.92 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.79 
 
 
447 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.94 
 
 
454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  36.62 
 
 
445 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  30.94 
 
 
432 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.97 
 
 
475 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  28.04 
 
 
461 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  31.63 
 
 
452 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  30.21 
 
 
470 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  30.81 
 
 
433 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  28.61 
 
 
455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  31.09 
 
 
433 aa  154  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.25 
 
 
440 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  34.2 
 
 
767 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  28.65 
 
 
473 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  32.37 
 
 
453 aa  150  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  29.08 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  30.79 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  28.07 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.87 
 
 
438 aa  146  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  28.61 
 
 
456 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30.18 
 
 
458 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.54 
 
 
555 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  28.61 
 
 
456 aa  143  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  31.44 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  31.22 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  30.67 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.44 
 
 
452 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  32.39 
 
 
464 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  30.03 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  28.34 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32.64 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.64 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  29.91 
 
 
440 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  31.14 
 
 
485 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  29.91 
 
 
432 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  30.26 
 
 
469 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.46 
 
 
565 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  30.51 
 
 
441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.31 
 
 
556 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.97 
 
 
440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  32.47 
 
 
563 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  31.91 
 
 
560 aa  136  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  32.21 
 
 
556 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  30.98 
 
 
564 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  31.96 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  30.58 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  32.6 
 
 
619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  32.7 
 
 
620 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.64 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.25 
 
 
440 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  30.79 
 
 
454 aa  133  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  31.87 
 
 
629 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.35 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  29.59 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  43.75 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.58 
 
 
557 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.77 
 
 
549 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  30.67 
 
 
454 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  32.95 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  29.91 
 
 
619 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  27.89 
 
 
629 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.7 
 
 
559 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  27.25 
 
 
576 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  29.6 
 
 
619 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.46 
 
 
549 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.76 
 
 
558 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  31.55 
 
 
457 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  27.27 
 
 
455 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  30.24 
 
 
588 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25.77 
 
 
480 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>