More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04036 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  100 
 
 		 455 aa  939    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  51.7 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  49.45 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  49.32 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  49.42 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  49.42 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  46.92 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  46.73 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  47.26 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  47.37 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  48.27 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  48.27 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  44.5 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  43.28 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  44.67 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  40.5 
 
 		 457 aa  332  6e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  34.26 
 
 		 560 aa  236  8e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  31.94 
 
 		 767 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  32.03 
 
 		 629 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  30.24 
 
 		 480 aa  219  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  27.95 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  26.87 
 
 		 468 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  27.75 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  27.93 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  26.38 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  27.8 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  28.89 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  28.07 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.89 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  30.57 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  27.33 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  27.58 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.03 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  32.09 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  29.38 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  29.24 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  26.51 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  30 
 
 		 543 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  30.92 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  24.14 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  27.97 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  26.7 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  25.35 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  26.33 
 
 		 475 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  25.93 
 
 		 461 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  30.28 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.51 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  28.2 
 
 		 453 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  28.27 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  27.97 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.57 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  27.27 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  27.52 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  26.88 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  29 
 
 		 499 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  25.87 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  29.28 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  27.76 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  23.85 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  28 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  27.03 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  26.32 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.33 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  26.01 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  27.29 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  27.41 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  26.51 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  26.08 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  26.89 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  29.03 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  26.65 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  26.65 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  26.65 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  26.53 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  27.81 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  26.89 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  24.64 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  26.89 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  26.82 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  29.61 
 
 		 299 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  26.67 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  27.88 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  26 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  28.12 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  33.75 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  24.9 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0637  putative ubiquinone biosynthesis protein  25.8 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.33 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  28.24 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.35 
 
 		 559 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.19 
 
 		 555 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  25.94 
 
 		 576 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  28.12 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  28.22 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  28.22 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  24.44 
 
 		 606 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  28.97 
 
 		 559 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  26.84 
 
 		 568 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.15 
 
 		 549 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>