More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0637 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0637  putative ubiquinone biosynthesis protein  100 
 
 
458 aa  934    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.58 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.99 
 
 
530 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.05 
 
 
480 aa  298  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.63 
 
 
480 aa  296  6e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.68 
 
 
519 aa  282  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  37.05 
 
 
542 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.55 
 
 
509 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.53 
 
 
504 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.11 
 
 
534 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.42 
 
 
524 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.71 
 
 
523 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.54 
 
 
558 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.29 
 
 
509 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.5 
 
 
514 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.94 
 
 
510 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.76 
 
 
527 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.16 
 
 
511 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.76 
 
 
527 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.7 
 
 
524 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.15 
 
 
527 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  36.41 
 
 
549 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.74 
 
 
553 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.9 
 
 
549 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.38 
 
 
493 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.92 
 
 
527 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.38 
 
 
509 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.84 
 
 
522 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.17 
 
 
508 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.68 
 
 
509 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.17 
 
 
520 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.47 
 
 
514 aa  257  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.53 
 
 
525 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.17 
 
 
521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.12 
 
 
521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36 
 
 
521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.6 
 
 
525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.7 
 
 
517 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.26 
 
 
526 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.63 
 
 
527 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.25 
 
 
521 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.92 
 
 
524 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.58 
 
 
537 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.92 
 
 
506 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.73 
 
 
534 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.6 
 
 
509 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.99 
 
 
524 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.93 
 
 
518 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.74 
 
 
524 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.42 
 
 
547 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.59 
 
 
546 aa  247  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.86 
 
 
517 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.67 
 
 
561 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.2 
 
 
520 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.87 
 
 
553 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.5 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.91 
 
 
540 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.11 
 
 
521 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.11 
 
 
521 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.74 
 
 
556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.68 
 
 
533 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.68 
 
 
533 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.65 
 
 
540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.62 
 
 
522 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.65 
 
 
540 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.38 
 
 
539 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.5 
 
 
524 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.25 
 
 
525 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.01 
 
 
557 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.99 
 
 
525 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.99 
 
 
525 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.73 
 
 
517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.04 
 
 
529 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.23 
 
 
517 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.42 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.77 
 
 
525 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.85 
 
 
521 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.93 
 
 
525 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.16 
 
 
525 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.34 
 
 
525 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.03 
 
 
527 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.3 
 
 
547 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.46 
 
 
534 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.77 
 
 
525 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.42 
 
 
524 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.92 
 
 
539 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.42 
 
 
525 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.92 
 
 
539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.32 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.51 
 
 
525 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.42 
 
 
525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.42 
 
 
525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.42 
 
 
525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>