More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0082 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.96 
 
 
526 aa  862    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.11 
 
 
525 aa  832    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  82.63 
 
 
524 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  82.92 
 
 
522 aa  859    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.68 
 
 
524 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  81.55 
 
 
518 aa  823    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
524 aa  1038    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60.98 
 
 
523 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  61.05 
 
 
525 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  61.39 
 
 
523 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.06 
 
 
520 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.87 
 
 
521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.2 
 
 
520 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.06 
 
 
520 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.07 
 
 
524 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.65 
 
 
517 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  59.45 
 
 
517 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.29 
 
 
527 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.35 
 
 
527 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.35 
 
 
527 aa  548  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.73 
 
 
524 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.77 
 
 
524 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.51 
 
 
527 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.86 
 
 
524 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.25 
 
 
529 aa  531  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.74 
 
 
534 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.19 
 
 
509 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.31 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.11 
 
 
511 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.23 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.77 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.94 
 
 
493 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  48 
 
 
509 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.09 
 
 
510 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.78 
 
 
512 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.97 
 
 
500 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.87 
 
 
519 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.52 
 
 
514 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.66 
 
 
519 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39 
 
 
476 aa  332  9e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.09 
 
 
547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.23 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.52 
 
 
480 aa  311  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.32 
 
 
553 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  39.91 
 
 
542 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.29 
 
 
561 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.57 
 
 
553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.36 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.64 
 
 
530 aa  303  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.26 
 
 
558 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.32 
 
 
522 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.18 
 
 
509 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.67 
 
 
504 aa  299  9e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0305  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.12 
 
 
560 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0481  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.12 
 
 
560 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0128618  hitchhiker  0.0000163657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.1 
 
 
521 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.21 
 
 
546 aa  296  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  31.47 
 
 
549 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.63 
 
 
522 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.8 
 
 
527 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.48 
 
 
514 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  31.32 
 
 
549 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.77 
 
 
525 aa  293  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.62 
 
 
517 aa  292  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.41 
 
 
521 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.18 
 
 
525 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.44 
 
 
557 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.95 
 
 
525 aa  290  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.92 
 
 
525 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.48 
 
 
521 aa  289  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.69 
 
 
521 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.6 
 
 
521 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.65 
 
 
547 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.73 
 
 
525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.4 
 
 
517 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.38 
 
 
537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.73 
 
 
525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.73 
 
 
525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.73 
 
 
525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.32 
 
 
522 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.59 
 
 
525 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.28 
 
 
521 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.04 
 
 
525 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.81 
 
 
525 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  36.56 
 
 
541 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1599  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.91 
 
 
528 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.9 
 
 
549 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1894  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.53 
 
 
528 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.11 
 
 
540 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.13 
 
 
541 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.98 
 
 
540 aa  279  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.58 
 
 
527 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.87 
 
 
533 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>