More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3797 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
519 aa  1037    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.57 
 
 
534 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.91 
 
 
524 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.15 
 
 
524 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.04 
 
 
527 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.93 
 
 
524 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.75 
 
 
527 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.35 
 
 
524 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.87 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.04 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.83 
 
 
527 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.83 
 
 
527 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.71 
 
 
529 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.89 
 
 
520 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.89 
 
 
521 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.09 
 
 
524 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.71 
 
 
519 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.53 
 
 
520 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.26 
 
 
526 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.49 
 
 
524 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.71 
 
 
525 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.6 
 
 
520 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.42 
 
 
509 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.31 
 
 
510 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.11 
 
 
522 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.3 
 
 
517 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.72 
 
 
530 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.43 
 
 
558 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.88 
 
 
518 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.44 
 
 
553 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.17 
 
 
509 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.95 
 
 
517 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.21 
 
 
523 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.77 
 
 
525 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.52 
 
 
509 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.28 
 
 
493 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.28 
 
 
509 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.72 
 
 
523 aa  362  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.08 
 
 
546 aa  360  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.5 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.8 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.47 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.01 
 
 
480 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  42.66 
 
 
542 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.05 
 
 
553 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.74 
 
 
561 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.38 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.19 
 
 
547 aa  343  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.35 
 
 
556 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  37.26 
 
 
549 aa  339  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  43.06 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  37.05 
 
 
549 aa  336  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  39.92 
 
 
544 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.33 
 
 
540 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.18 
 
 
557 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.83 
 
 
512 aa  330  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.25 
 
 
543 aa  329  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.92 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.26 
 
 
541 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.23 
 
 
557 aa  326  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.52 
 
 
546 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  41.05 
 
 
541 aa  326  6e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.88 
 
 
549 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.27 
 
 
504 aa  326  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.88 
 
 
549 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.2 
 
 
544 aa  326  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.88 
 
 
549 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.88 
 
 
549 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.17 
 
 
547 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.72 
 
 
506 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.64 
 
 
544 aa  325  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  37.03 
 
 
549 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.13 
 
 
549 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.37 
 
 
527 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.19 
 
 
521 aa  320  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.88 
 
 
522 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.33 
 
 
521 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.81 
 
 
522 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1894  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.1 
 
 
528 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.71 
 
 
533 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.74 
 
 
549 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.3 
 
 
549 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.68 
 
 
537 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.09 
 
 
521 aa  317  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.53 
 
 
549 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.58 
 
 
514 aa  316  8e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  37.58 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.34 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.32 
 
 
549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.44 
 
 
546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.26 
 
 
549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.86 
 
 
521 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.32 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  42.35 
 
 
525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.39 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.14 
 
 
517 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.36 
 
 
544 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.67 
 
 
525 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.67 
 
 
525 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>