More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3571 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 		 524 aa  1051    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  67.11 
 
 		 527 aa  718    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  69.02 
 
 		 527 aa  732    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.75 
 
 		 529 aa  637    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  75.76 
 
 		 524 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  76.15 
 
 		 527 aa  821    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  68.55 
 
 		 524 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  67.11 
 
 		 527 aa  717    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  75.38 
 
 		 524 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.07 
 
 		 523 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.06 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.77 
 
 		 524 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.94 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.17 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.94 
 
 		 521 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.34 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.05 
 
 		 526 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.75 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.26 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.97 
 
 		 518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.46 
 
 		 524 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.04 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.12 
 
 		 524 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.82 
 
 		 534 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.88 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.04 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.93 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.49 
 
 		 511 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.87 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.67 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.67 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.33 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.94 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.21 
 
 		 500 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.25 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  45 
 
 		 519 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.02 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.81 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.91 
 
 		 519 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.96 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  44.9 
 
 		 542 aa  336  7e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.64 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.43 
 
 		 530 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.31 
 
 		 547 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.38 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.75 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.5 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.76 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.81 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.02 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.39 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.22 
 
 		 540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.71 
 
 		 547 aa  309  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  33.88 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  33.88 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36 
 
 		 556 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  36.81 
 
 		 549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.6 
 
 		 522 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.61 
 
 		 509 aa  302  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.23 
 
 		 544 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.39 
 
 		 546 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.24 
 
 		 527 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.2 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.5 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.03 
 
 		 544 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.07 
 
 		 540 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.95 
 
 		 539 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.84 
 
 		 539 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.42 
 
 		 546 aa  297  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.8 
 
 		 546 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.34 
 
 		 521 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.8 
 
 		 546 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.8 
 
 		 546 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.8 
 
 		 546 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.8 
 
 		 546 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.68 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  38.89 
 
 		 544 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.6 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.13 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  35.43 
 
 		 529 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.34 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.61 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.29 
 
 		 539 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.85 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.23 
 
 		 549 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.96 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.96 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.96 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.96 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.56 
 
 		 549 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.89 
 
 		 543 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.54 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>