More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3027 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  71.96 
 
 
493 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  71.07 
 
 
509 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  72.37 
 
 
509 aa  737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
508 aa  1023    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  70.53 
 
 
509 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  72.37 
 
 
509 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  70 
 
 
511 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.19 
 
 
525 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.58 
 
 
517 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.46 
 
 
527 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.46 
 
 
527 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.57 
 
 
527 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.58 
 
 
524 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.87 
 
 
524 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.44 
 
 
523 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.19 
 
 
524 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.91 
 
 
534 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.24 
 
 
520 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.24 
 
 
521 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.28 
 
 
524 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.8 
 
 
520 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.19 
 
 
527 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.21 
 
 
517 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.49 
 
 
529 aa  408  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.98 
 
 
526 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.58 
 
 
524 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.26 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.89 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.57 
 
 
518 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.32 
 
 
525 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.74 
 
 
524 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.95 
 
 
519 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.2 
 
 
520 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.49 
 
 
523 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.03 
 
 
514 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.86 
 
 
510 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.39 
 
 
500 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.38 
 
 
509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.23 
 
 
553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  43.16 
 
 
476 aa  333  4e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  35.15 
 
 
549 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.64 
 
 
547 aa  333  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  34.96 
 
 
549 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.91 
 
 
558 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.64 
 
 
512 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.79 
 
 
506 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.38 
 
 
553 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.95 
 
 
530 aa  329  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.47 
 
 
519 aa  329  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  42.14 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.51 
 
 
522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.75 
 
 
525 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.75 
 
 
525 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.75 
 
 
525 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.13 
 
 
525 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.82 
 
 
561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.29 
 
 
537 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.92 
 
 
525 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.92 
 
 
525 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.29 
 
 
547 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.92 
 
 
525 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.05 
 
 
517 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.79 
 
 
533 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.43 
 
 
517 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
525 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.79 
 
 
533 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.67 
 
 
504 aa  316  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.7 
 
 
540 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  36.73 
 
 
541 aa  312  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.54 
 
 
541 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.59 
 
 
525 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.12 
 
 
521 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.72 
 
 
527 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.45 
 
 
521 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  37.82 
 
 
544 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.54 
 
 
522 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.2 
 
 
480 aa  309  8e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.63 
 
 
522 aa  309  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.97 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.23 
 
 
514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.38 
 
 
540 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.4 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.33 
 
 
546 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.98 
 
 
534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.92 
 
 
544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.39 
 
 
539 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.87 
 
 
521 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.72 
 
 
527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.39 
 
 
539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  37.3 
 
 
529 aa  303  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.88 
 
 
544 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.27 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.13 
 
 
525 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>