More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0006 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
509 aa  1016    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  99.39 
 
 
493 aa  978    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  73.35 
 
 
509 aa  729    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  71.73 
 
 
509 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  72.37 
 
 
508 aa  737    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  94.11 
 
 
509 aa  974    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  74.04 
 
 
511 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.66 
 
 
517 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.04 
 
 
520 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.1 
 
 
520 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.04 
 
 
521 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.67 
 
 
524 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.3 
 
 
534 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.06 
 
 
525 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.74 
 
 
527 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.74 
 
 
527 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.61 
 
 
524 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  54.4 
 
 
524 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.56 
 
 
517 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.35 
 
 
527 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.23 
 
 
524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.86 
 
 
527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.93 
 
 
520 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.25 
 
 
523 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.77 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.48 
 
 
526 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.91 
 
 
522 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.22 
 
 
524 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.68 
 
 
525 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.14 
 
 
524 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.46 
 
 
518 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.41 
 
 
529 aa  391  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.76 
 
 
523 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.36 
 
 
519 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.11 
 
 
510 aa  362  9e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.4 
 
 
514 aa  359  7e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.61 
 
 
500 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.28 
 
 
519 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.27 
 
 
512 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.75 
 
 
509 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.19 
 
 
530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.82 
 
 
476 aa  324  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.82 
 
 
558 aa  323  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.43 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.36 
 
 
553 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.1 
 
 
547 aa  316  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.69 
 
 
506 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  43.15 
 
 
542 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.46 
 
 
522 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.97 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.97 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.97 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.97 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.27 
 
 
527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.97 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.38 
 
 
521 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.59 
 
 
544 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.49 
 
 
551 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.86 
 
 
547 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.35 
 
 
544 aa  309  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  40.87 
 
 
544 aa  309  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.86 
 
 
517 aa  309  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.73 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.33 
 
 
522 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.83 
 
 
546 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.49 
 
 
546 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.05 
 
 
561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.71 
 
 
504 aa  306  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.39 
 
 
521 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.05 
 
 
517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.51 
 
 
522 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.66 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  34.96 
 
 
549 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.86 
 
 
557 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.86 
 
 
549 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.02 
 
 
514 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.11 
 
 
549 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.46 
 
 
480 aa  300  3e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.88 
 
 
533 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.56 
 
 
546 aa  300  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  34.75 
 
 
549 aa  299  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.53 
 
 
537 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.48 
 
 
525 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.88 
 
 
533 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37 
 
 
549 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.55 
 
 
540 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.01 
 
 
543 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.14 
 
 
525 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.67 
 
 
480 aa  297  3e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.14 
 
 
525 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.14 
 
 
525 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.58 
 
 
540 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.66 
 
 
521 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>