More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3657 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
534 aa  1064    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  53.74 
 
 
524 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.83 
 
 
526 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  57.05 
 
 
524 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.97 
 
 
525 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.98 
 
 
522 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.82 
 
 
524 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.07 
 
 
524 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.35 
 
 
524 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.03 
 
 
527 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.57 
 
 
524 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.03 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.54 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.37 
 
 
524 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.35 
 
 
527 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.93 
 
 
525 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.05 
 
 
518 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.38 
 
 
523 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.12 
 
 
520 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.12 
 
 
521 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.66 
 
 
529 aa  476  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.66 
 
 
520 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.11 
 
 
517 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.2 
 
 
517 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.92 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.66 
 
 
523 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.88 
 
 
511 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.77 
 
 
519 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.26 
 
 
509 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.91 
 
 
508 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  53.3 
 
 
493 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.23 
 
 
509 aa  422  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.3 
 
 
509 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.59 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.09 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.13 
 
 
514 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.28 
 
 
512 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.32 
 
 
519 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.25 
 
 
500 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.22 
 
 
547 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  43.86 
 
 
476 aa  344  2e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.8 
 
 
558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.54 
 
 
530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.74 
 
 
480 aa  334  2e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.91 
 
 
480 aa  334  3e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.18 
 
 
540 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.1 
 
 
553 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.05 
 
 
509 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.44 
 
 
547 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.49 
 
 
561 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.42 
 
 
546 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.1 
 
 
553 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  40.49 
 
 
542 aa  322  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.03 
 
 
517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.72 
 
 
527 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.33 
 
 
525 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  34.27 
 
 
549 aa  317  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.18 
 
 
506 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.03 
 
 
504 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  33.87 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.29 
 
 
549 aa  312  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.37 
 
 
540 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.43 
 
 
525 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  38.44 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.81 
 
 
534 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.53 
 
 
537 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.41 
 
 
544 aa  306  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.32 
 
 
527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.59 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.86 
 
 
522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.36 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.06 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.76 
 
 
525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.75 
 
 
557 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.46 
 
 
539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.76 
 
 
525 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.76 
 
 
525 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.52 
 
 
525 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.46 
 
 
539 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.95 
 
 
556 aa  302  9e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.15 
 
 
549 aa  302  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.52 
 
 
549 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.27 
 
 
549 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.27 
 
 
549 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
540 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.72 
 
 
533 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.81 
 
 
539 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.45 
 
 
549 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.34 
 
 
525 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.51 
 
 
533 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.52 
 
 
525 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.58 
 
 
525 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.58 
 
 
525 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.52 
 
 
525 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.52 
 
 
525 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.49 
 
 
549 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.04 
 
 
549 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.04 
 
 
549 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.81 
 
 
549 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.62 
 
 
557 aa  300  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>