More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1060 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  100 
 
 		 495 aa  1033    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  94.75 
 
 		 495 aa  986    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  60.76 
 
 		 486 aa  581  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  41.99 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  30.69 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.5 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  29.86 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  30.67 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  30.42 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  29.46 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  29.4 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  28.85 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  28.91 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  28.74 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  28.24 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  28.41 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.19 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  27.92 
 
 		 480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  30.12 
 
 		 767 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  27.86 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.65 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  26.38 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  28.38 
 
 		 629 aa  147  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.79 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  24.62 
 
 		 433 aa  144  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  26.51 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  28.75 
 
 		 560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  25.22 
 
 		 434 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  27.98 
 
 		 555 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  29.56 
 
 		 555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  27.38 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  26.65 
 
 		 555 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.75 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.62 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  25.97 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  25.06 
 
 		 660 aa  120  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  25.95 
 
 		 564 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  31.84 
 
 		 550 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  30.11 
 
 		 480 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  27.38 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.27 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  25.62 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  31.58 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  25.17 
 
 		 438 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  32.47 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  27.65 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  27.34 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  27.95 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  30.5 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.28 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.41 
 
 		 578 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  25 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  31.27 
 
 		 563 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  28.37 
 
 		 571 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  27.08 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  28.38 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  31.44 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  27.27 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  27.25 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  30 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1295  hypothetical protein  28.36 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  26.17 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  25.5 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  32.22 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  26.65 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  28.86 
 
 		 570 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  24.01 
 
 		 438 aa  107  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.72 
 
 		 555 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.24 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  24.42 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  26.04 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  25.76 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  26.82 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  25.63 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  24.47 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  23.18 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.47 
 
 		 561 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  25.68 
 
 		 557 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  27.62 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  28.43 
 
 		 553 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  27.06 
 
 		 585 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  24.37 
 
 		 561 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  26.42 
 
 		 452 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  26.39 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.96 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  24.78 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.21 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  24.71 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  28.73 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  28.73 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  26.01 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  26.85 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  26.28 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.77 
 
 		 563 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  27.27 
 
 		 568 aa  99.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  30.62 
 
 		 557 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  27.11 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  24.61 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.62 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  25.16 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>