More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000564 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  100 
 
 		 440 aa  911    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  94.77 
 
 		 440 aa  839    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  51.4 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  50.68 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  50.57 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  49.53 
 
 		 432 aa  458  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  46.85 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  46.39 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  47.38 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  47.09 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  46.62 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  47.09 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  46.39 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  45.01 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  42.49 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  37.47 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  35.33 
 
 		 767 aa  280  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  36.99 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  33.63 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  32.94 
 
 		 629 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.06 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  29.95 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  27.65 
 
 		 495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  27.89 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  27.16 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  32.55 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  29.82 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  28.67 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  33.77 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  32.7 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  27.94 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  29.72 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  26.54 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  27.8 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  30.68 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  30.68 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  30.18 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  28.49 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  30.18 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  30.18 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  30.36 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.06 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 		 462 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  26.57 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.19 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  26.7 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  25.71 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  27.19 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  26.07 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  27.54 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  26.03 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  31.46 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  27.53 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  27.53 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  27.23 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  28.36 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  26.53 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  28.21 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  29.03 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  26.73 
 
 		 499 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  28.06 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  28.18 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  26.59 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  27.97 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  25.98 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.89 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  26.39 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.82 
 
 		 556 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  29.26 
 
 		 445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.47 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  28.79 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  25.56 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  26.52 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  25.85 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  23.84 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  25.55 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  25.6 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  27.96 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.26 
 
 		 557 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  30.26 
 
 		 557 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.37 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  32.54 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  32.54 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  30.26 
 
 		 557 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  29.22 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.83 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  30 
 
 		 618 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  24.6 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  29.04 
 
 		 550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  31.1 
 
 		 565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  32.26 
 
 		 556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  31.1 
 
 		 565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  28.28 
 
 		 568 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  31.19 
 
 		 618 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.14 
 
 		 559 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  30.54 
 
 		 616 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  29.15 
 
 		 619 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>