More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3301 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  923    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  80.91 
 
 		 451 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  81.14 
 
 		 451 aa  715    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  63.8 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  64.98 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  56.54 
 
 		 432 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  56.82 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  57.24 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  53.69 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  53.79 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  52.19 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  46.92 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  46.12 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  46.62 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  46.74 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  43.34 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  38.57 
 
 		 560 aa  292  9e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  37.53 
 
 		 767 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  35.02 
 
 		 629 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  33.48 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  29.4 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  37.26 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  29.5 
 
 		 495 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  28.7 
 
 		 434 aa  173  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  26.68 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.43 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.66 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  29.14 
 
 		 486 aa  163  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  26.71 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  31.03 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  31.07 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.52 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.45 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.81 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30.11 
 
 		 448 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  34.05 
 
 		 447 aa  153  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  30.95 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  30.57 
 
 		 543 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  30.93 
 
 		 445 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  27.4 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  31 
 
 		 451 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  32.64 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  28.38 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.37 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  30.36 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  31.43 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  32.39 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  28.9 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  32.22 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  32.36 
 
 		 574 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  30.15 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  30.36 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  30.11 
 
 		 456 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  25.81 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  29.46 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  29.81 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  29.73 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  29.73 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  25.9 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.07 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  30.61 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  29.98 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  33.91 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  24.66 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  30.2 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  30.94 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.93 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  30.95 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  29.12 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  28.8 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  27.59 
 
 		 485 aa  123  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  30.23 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  26.95 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  30.46 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.71 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  28.87 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  31.15 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25.62 
 
 		 480 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  26.82 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  25.57 
 
 		 660 aa  117  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  23.76 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  26.88 
 
 		 445 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  29.03 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  29.9 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  28.12 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.53 
 
 		 450 aa  113  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  29.45 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  25.45 
 
 		 558 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  36.78 
 
 		 556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.43 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.43 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.77 
 
 		 547 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  28.03 
 
 		 560 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3134  aminotransferase class-III  34.62 
 
 		 875 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  29.34 
 
 		 550 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 		 556 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  25.07 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  25.07 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.1 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  30.99 
 
 		 299 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>