More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07540 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  909    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  67.97 
 
 		 434 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  68.91 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  54.29 
 
 		 438 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  53.05 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  54.1 
 
 		 440 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  27.75 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.88 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  27.6 
 
 		 473 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  28.7 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  27 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  28.1 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  26.39 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  28.64 
 
 		 574 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  25.93 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  26.71 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  27.42 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  27.13 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  28.12 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  26.34 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  26.26 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.3 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  25.81 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  26.02 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.64 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  25.99 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  30.23 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  26.11 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  32.27 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  26.62 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  29.47 
 
 		 440 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  24.06 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  26.44 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  25.33 
 
 		 499 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  30.32 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  30.51 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  29.15 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  28.77 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.4 
 
 		 689 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  26.2 
 
 		 564 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  28.47 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  28.47 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  26.34 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  28.1 
 
 		 438 aa  133  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  26.06 
 
 		 454 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.3 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  28.81 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  24.04 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  28.81 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.92 
 
 		 619 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  25.74 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  25.22 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  25.99 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  27.03 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  29.67 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  29.49 
 
 		 619 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  26.1 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  26.8 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  25.85 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  25.85 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  25.51 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 		 557 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  27.81 
 
 		 616 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  29.49 
 
 		 619 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  26.27 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  25.93 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 561 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.01 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  29.77 
 
 		 659 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3296  hypothetical protein  31.62 
 
 		 684 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 584 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  26.9 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  29.43 
 
 		 576 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40532  predicted protein  27.67 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.41809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  24.2 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  31.27 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  25 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  25.83 
 
 		 665 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  25.83 
 
 		 665 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  22.81 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.4 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1231  predicted protein  26.71 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35349  predicted protein  26.15 
 
 		 475 aa  120  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0653065  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  27.92 
 
 		 618 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  25.64 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  25.22 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  25.22 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  27.54 
 
 		 629 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  24.66 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  23.91 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  28.17 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  30.11 
 
 		 583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  24.1 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  24.05 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  24.43 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  23.97 
 
 		 495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  26.81 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  24.37 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  24.74 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  28.03 
 
 		 618 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>