More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1420 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  1007    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  60.97 
 
 
495 aa  586  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  60.76 
 
 
495 aa  581  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  43.3 
 
 
468 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  31.53 
 
 
440 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33 
 
 
440 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  30.83 
 
 
432 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.74 
 
 
454 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  31.73 
 
 
451 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  32.08 
 
 
466 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  30.94 
 
 
446 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  31.49 
 
 
451 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.08 
 
 
469 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  27.74 
 
 
457 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  28.38 
 
 
434 aa  170  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.38 
 
 
441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  29.14 
 
 
464 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  27.57 
 
 
480 aa  162  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  28.79 
 
 
767 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.89 
 
 
440 aa  156  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  27.93 
 
 
455 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  29.19 
 
 
440 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  28.01 
 
 
629 aa  153  7e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  28.89 
 
 
457 aa  153  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.66 
 
 
432 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  26.91 
 
 
560 aa  146  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.79 
 
 
433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  32.62 
 
 
555 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.91 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  27.25 
 
 
453 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  28.37 
 
 
564 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  31.69 
 
 
555 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  27.23 
 
 
447 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  27.14 
 
 
461 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  25.11 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  28.8 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  26.97 
 
 
448 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  33.87 
 
 
563 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  26.65 
 
 
499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  26.01 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  29.57 
 
 
555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  26.42 
 
 
455 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  30.56 
 
 
555 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  32.97 
 
 
550 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  24.73 
 
 
660 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.55 
 
 
433 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  26.97 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  30.34 
 
 
559 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  25.11 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  31.16 
 
 
559 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.09 
 
 
440 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.73 
 
 
438 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  25.22 
 
 
451 aa  114  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  26.87 
 
 
470 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  24.46 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  26.09 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  25.17 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  26.65 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  23.83 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  28.26 
 
 
563 aa  110  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  24.94 
 
 
443 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  29.62 
 
 
552 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  30.89 
 
 
574 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  32.69 
 
 
565 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  26.42 
 
 
448 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  26.34 
 
 
475 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 
438 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  25.69 
 
 
452 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  25.39 
 
 
445 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.22 
 
 
458 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.53 
 
 
559 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  26.72 
 
 
473 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  27.35 
 
 
571 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  27.12 
 
 
551 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  25.43 
 
 
440 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  26.75 
 
 
455 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  27.54 
 
 
447 aa  104  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.98 
 
 
561 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  27.24 
 
 
578 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  25.92 
 
 
560 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  26.39 
 
 
561 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  26.4 
 
 
584 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  25.68 
 
 
559 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  26.85 
 
 
541 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.66 
 
 
555 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  24.35 
 
 
445 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  30.6 
 
 
450 aa  101  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27067  predicted protein  28.44 
 
 
470 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  26.61 
 
 
481 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  24.48 
 
 
453 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  25.99 
 
 
585 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  22.71 
 
 
473 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  25.22 
 
 
543 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  26.26 
 
 
570 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  27.25 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  28.67 
 
 
454 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.92 
 
 
559 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  26.71 
 
 
557 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  27.73 
 
 
462 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  27.97 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>