More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1481 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  922    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  67.77 
 
 
454 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  58.74 
 
 
452 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  54.46 
 
 
461 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  50.91 
 
 
453 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  52.13 
 
 
455 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  53.09 
 
 
470 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  51.82 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  52.05 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  50.9 
 
 
456 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  51.47 
 
 
456 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  51.47 
 
 
456 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  51.59 
 
 
453 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  51.69 
 
 
456 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  39.15 
 
 
543 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  32.28 
 
 
438 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.09 
 
 
462 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  29.37 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.77 
 
 
448 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  29.16 
 
 
458 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 
438 aa  170  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.58 
 
 
477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.86 
 
 
473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  27.38 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  27 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  38.11 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.12 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  37.74 
 
 
475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  34.67 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  31.72 
 
 
485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  33.82 
 
 
574 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  34.93 
 
 
451 aa  163  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  28.9 
 
 
445 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  37.01 
 
 
448 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  29.65 
 
 
448 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  33.33 
 
 
445 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  31.62 
 
 
455 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  35.94 
 
 
437 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.33 
 
 
433 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  28.05 
 
 
433 aa  159  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  31.19 
 
 
447 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  30.47 
 
 
441 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  28.6 
 
 
499 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  34.46 
 
 
483 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  37.8 
 
 
558 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  31.63 
 
 
476 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  28.61 
 
 
434 aa  156  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  27.52 
 
 
445 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  34.56 
 
 
436 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  34.65 
 
 
440 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  36.3 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.11 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  30.57 
 
 
445 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  30.31 
 
 
445 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  30.31 
 
 
445 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  36.92 
 
 
558 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.56 
 
 
440 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  32.55 
 
 
470 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.52 
 
 
481 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  30.63 
 
 
480 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  27.29 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  31.77 
 
 
576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  26.83 
 
 
432 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  29.74 
 
 
445 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.24 
 
 
446 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.85 
 
 
557 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  29.84 
 
 
440 aa  143  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  26.98 
 
 
564 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  28.04 
 
 
556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  34.98 
 
 
583 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.97 
 
 
559 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 
552 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  37.65 
 
 
588 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  26.57 
 
 
440 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.6 
 
 
549 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.1 
 
 
468 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  32.79 
 
 
454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.09 
 
 
555 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  28.97 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 
566 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  29.25 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  36.44 
 
 
610 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.72 
 
 
556 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.57 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3101  ABC-1 domain protein  32.36 
 
 
564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  28.74 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.67 
 
 
549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.11 
 
 
554 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  26 
 
 
440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.24 
 
 
558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  26.72 
 
 
629 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  29.07 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  28.42 
 
 
454 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  28.61 
 
 
563 aa  130  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.01 
 
 
555 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  26.62 
 
 
767 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.68 
 
 
689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  36.76 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>