More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0062 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  892    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  67.97 
 
 
440 aa  630  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  66.9 
 
 
433 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  55.92 
 
 
438 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  54.06 
 
 
440 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  50.93 
 
 
441 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  29.33 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25.55 
 
 
480 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  28.87 
 
 
475 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  26.48 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  28.61 
 
 
452 aa  156  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  26.05 
 
 
483 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  26.97 
 
 
453 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  27.5 
 
 
437 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  27.05 
 
 
448 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  26.83 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  25.19 
 
 
447 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  26.91 
 
 
564 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  25.3 
 
 
461 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  26.11 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  25.35 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  27.08 
 
 
574 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  30.45 
 
 
582 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  27.73 
 
 
462 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  29.55 
 
 
473 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  26.05 
 
 
433 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  27.31 
 
 
543 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  29.41 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  24.65 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  24.82 
 
 
457 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  25.07 
 
 
454 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  24.77 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  25.58 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  22.94 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  30.82 
 
 
440 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  27.58 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  28.66 
 
 
619 aa  130  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  23.91 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  25.58 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  22.95 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  24.89 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  24.59 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  28.75 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  29.88 
 
 
576 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  25.35 
 
 
455 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18521  hypothetical protein  29.96 
 
 
616 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0520951  normal  0.0416558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  23.46 
 
 
466 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  24.65 
 
 
453 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  28.1 
 
 
585 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  23.4 
 
 
453 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  24.73 
 
 
480 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  27.39 
 
 
551 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  24.82 
 
 
454 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  25.77 
 
 
499 aa  123  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  24.62 
 
 
495 aa  122  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  25.11 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  23.99 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  30.83 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  24.55 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  28.3 
 
 
666 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 
584 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  23.85 
 
 
455 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  26.09 
 
 
476 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  24.54 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3296  hypothetical protein  29.68 
 
 
684 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.52 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.94 
 
 
561 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  24.05 
 
 
457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  23.82 
 
 
456 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  24.12 
 
 
456 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  23.98 
 
 
440 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  28.62 
 
 
659 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  23.58 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  25.35 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  27.41 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  24.93 
 
 
456 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  23.76 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30.04 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.57 
 
 
578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  23.91 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  27.92 
 
 
689 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  28.33 
 
 
619 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30211  putative protein kinase:ABC1 family  28.04 
 
 
629 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.286436 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  25.17 
 
 
432 aa  117  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  24.83 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0375  ABC-1 domain protein  28.52 
 
 
665 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  28.52 
 
 
665 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.7 
 
 
561 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  28.83 
 
 
618 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  25.8 
 
 
557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  28.83 
 
 
618 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  28.33 
 
 
619 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1231  predicted protein  27.27 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.66 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  30.66 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  26.47 
 
 
670 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  29.74 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  26.52 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  24.77 
 
 
440 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  22.58 
 
 
470 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>