More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4216 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  91.83 
 
 		 466 aa  854    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  933    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  64.98 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  64.35 
 
 		 451 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  64.35 
 
 		 451 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  56.68 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  59.68 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  57.88 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  56.78 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  49.42 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  53.21 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  51.76 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  46.81 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  46.85 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  46.39 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  48.76 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  37.1 
 
 		 629 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  36.77 
 
 		 767 aa  279  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  36.95 
 
 		 560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  33.77 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  30.69 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.63 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.73 
 
 		 432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  34.98 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  34.62 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  31.08 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.88 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  31.78 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  36.44 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  31.83 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.36 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  32.86 
 
 		 543 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  28.24 
 
 		 495 aa  170  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  31.15 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.84 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  28.87 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  33.63 
 
 		 470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  31.94 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  31.09 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  32.54 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  32.22 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.8 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  32.39 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.73 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  31.43 
 
 		 574 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  31.88 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  33.69 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.86 
 
 		 438 aa  153  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  29.31 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  32.39 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  29.49 
 
 		 483 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  34.6 
 
 		 453 aa  150  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  28.86 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.69 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  32.62 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  32.62 
 
 		 456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  28.77 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  29.95 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  31.61 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  31.33 
 
 		 447 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  31.09 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  31.09 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  30.5 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  32.42 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  28.18 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  30.49 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25.65 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.26 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  30.95 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.45 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  29.25 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  24.1 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  28.3 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.35 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  27.87 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.22 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  29.95 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  24.19 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.23 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  27.63 
 
 		 454 aa  123  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.35 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  23.99 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  22.43 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  23.79 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.11 
 
 		 549 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.23 
 
 		 550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  27.53 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.98 
 
 		 599 aa  113  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.74 
 
 		 554 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  36.87 
 
 		 299 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.89 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3134  aminotransferase class-III  34.38 
 
 		 875 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  27.75 
 
 		 549 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  28.57 
 
 		 640 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  26.7 
 
 		 564 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.92 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>