More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3257 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  70.11 
 
 		 453 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 456 aa  924    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  70.42 
 
 		 455 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  69.23 
 
 		 453 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  69.25 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  66.74 
 
 		 456 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  66.52 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  68.87 
 
 		 453 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  66.52 
 
 		 456 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  61.25 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  58.85 
 
 		 455 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  56.29 
 
 		 452 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  51.69 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  49.32 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  29.05 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.48 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.62 
 
 		 558 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  26.9 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  30.79 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  32.08 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  30.89 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  30.66 
 
 		 543 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.95 
 
 		 574 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.1 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  27.47 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  32.88 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  29.21 
 
 		 599 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  29.97 
 
 		 446 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  29.03 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  28.23 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  28.37 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.21 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  30.96 
 
 		 588 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.35 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.25 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.08 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32.25 
 
 		 451 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  30.2 
 
 		 610 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.96 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  31.77 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.29 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.49 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.42 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0666  kinase  27.12 
 
 		 548 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  32.69 
 
 		 476 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  30.64 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  33.44 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.46 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  33.44 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  30.49 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.44 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  30.15 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.69 
 
 		 454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  29.77 
 
 		 576 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  28.86 
 
 		 555 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  31.7 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  29.4 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  28.41 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  26.82 
 
 		 537 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  26 
 
 		 537 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  28.57 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  33.12 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.59 
 
 		 558 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  26.86 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  28.71 
 
 		 557 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  27.99 
 
 		 578 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  33.01 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  29.45 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.36 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  28.95 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  29.05 
 
 		 480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  27.96 
 
 		 640 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11731  kinase  25.19 
 
 		 552 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.238536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  28.09 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  23.65 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14981  kinase  26.44 
 
 		 548 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  26.82 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  29.37 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.21 
 
 		 557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1094  kinase-like  24.94 
 
 		 552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.33 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  27.42 
 
 		 569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  28.39 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11891  kinase  24.69 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  27.48 
 
 		 666 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  27.88 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  32.24 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.45 
 
 		 557 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.16 
 
 		 564 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11901  kinase  25.49 
 
 		 551 aa  133  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16095  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  28.61 
 
 		 565 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.59 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  28.61 
 
 		 565 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1379  kinase  28.64 
 
 		 549 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  28.12 
 
 		 499 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09851  kinase  27.43 
 
 		 564 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.82 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>