More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0934 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 436 aa  868    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  71.03 
 
 		 448 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  64.5 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  59.68 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  59.55 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  61.38 
 
 		 543 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  57.75 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  58.26 
 
 		 448 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  58.49 
 
 		 438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  59.4 
 
 		 574 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  59.22 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  57.34 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  54.71 
 
 		 455 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  55.5 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  52.74 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  53.21 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  52.75 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  53.12 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  53.12 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  53.12 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  52.52 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  54.63 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  50.35 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  36.45 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  33.87 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.65 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.64 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.73 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  35.9 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.07 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  35.09 
 
 		 461 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  36.21 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  30.37 
 
 		 564 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  30.41 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  30.13 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  30.13 
 
 		 455 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  35.67 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  32 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  32.17 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.69 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  34.56 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  27.09 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  35.62 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 473 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.81 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  32.35 
 
 		 450 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  32.94 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.49 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  35.13 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  32 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  34.46 
 
 		 629 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  34.63 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  29.95 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  36.88 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  32.35 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  31.66 
 
 		 619 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  25.4 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  33.78 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  34.29 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  27.11 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  33.96 
 
 		 537 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  31.44 
 
 		 619 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 562 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  29.49 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.18 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  31.94 
 
 		 525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  36.47 
 
 		 565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.59 
 
 		 619 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  27.75 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.17 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  33.44 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  32.81 
 
 		 567 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 		 565 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 		 565 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 440 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  29.56 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  34.36 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  31.34 
 
 		 788 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.84 
 
 		 666 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.1 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.98 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.34 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.23 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1499  hypothetical protein  33.58 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  34.39 
 
 		 563 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  29.12 
 
 		 659 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.92 
 
 		 454 aa  133  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  32.11 
 
 		 670 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  30.79 
 
 		 578 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  30.18 
 
 		 457 aa  133  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.21 
 
 		 558 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  24.77 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  33.98 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  32.29 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.91 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  26.82 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.2 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0384  ABC-1 domain protein  30.65 
 
 		 665 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>