More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0938 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  75.13 
 
 		 574 aa  790    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1055    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  68.42 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  67.73 
 
 		 448 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  65.47 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  64.59 
 
 		 445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  64.14 
 
 		 437 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  64.51 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  63.45 
 
 		 455 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  66.13 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  61.38 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  56.69 
 
 		 443 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  58.06 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  58.11 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  54.63 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  49.66 
 
 		 447 aa  422  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  50.35 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  50.35 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  50.35 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  49.43 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  52.2 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  48.52 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  48.51 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  37.39 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.99 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  37.83 
 
 		 454 aa  203  6e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  35.47 
 
 		 476 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  36.22 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  36.75 
 
 		 470 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  34.3 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  39.15 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29.53 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  31.91 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  32.86 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 		 481 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  31.44 
 
 		 433 aa  170  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.43 
 
 		 455 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  36.1 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  34.24 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  33.33 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  34.52 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.5 
 
 		 434 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  37.29 
 
 		 452 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.74 
 
 		 466 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  34.01 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  34.43 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32.15 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.15 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  31.39 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  35.38 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  34.54 
 
 		 450 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  31.42 
 
 		 564 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  34.59 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  34.92 
 
 		 629 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  33.81 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.12 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  29.7 
 
 		 453 aa  154  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  32.11 
 
 		 470 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  36.93 
 
 		 456 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  29.43 
 
 		 440 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  34.04 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  35.6 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  36.33 
 
 		 485 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  28.84 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  30.42 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  32.99 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  36.59 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.87 
 
 		 557 aa  148  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  37.73 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.57 
 
 		 464 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  32.33 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  37.82 
 
 		 565 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  32.33 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  30.68 
 
 		 440 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  37.21 
 
 		 767 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  32.69 
 
 		 567 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  31.4 
 
 		 788 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  28.88 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  28.03 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  34.41 
 
 		 578 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  36.26 
 
 		 475 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  35.54 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  31.3 
 
 		 640 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  30.26 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.11 
 
 		 558 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  30 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.22 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.69 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  35.29 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  27.31 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  35.29 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.73 
 
 		 558 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  30.9 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  34.08 
 
 		 549 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.4 
 
 		 549 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  39.92 
 
 		 613 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.72 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 		 572 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 		 572 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>