More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4117 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  93.27 
 
 
448 aa  840    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  989    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  67.19 
 
 
448 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  64.51 
 
 
543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  63.04 
 
 
440 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  62.92 
 
 
574 aa  545  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  60.81 
 
 
451 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  57.59 
 
 
455 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  57.27 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  57.66 
 
 
445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  57.75 
 
 
436 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  56.98 
 
 
443 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  55.86 
 
 
448 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  54.2 
 
 
445 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  49.1 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  52.29 
 
 
447 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  47.2 
 
 
438 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  46.21 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  47.63 
 
 
445 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  47.86 
 
 
445 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  47.86 
 
 
445 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  46.07 
 
 
445 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  45.84 
 
 
445 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  33.48 
 
 
462 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  34.53 
 
 
470 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  33.63 
 
 
476 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.91 
 
 
481 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.55 
 
 
473 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.83 
 
 
469 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  33.68 
 
 
454 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.51 
 
 
454 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.68 
 
 
434 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  30.93 
 
 
466 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  31.8 
 
 
477 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  35.14 
 
 
461 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  34.38 
 
 
450 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  28.6 
 
 
452 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  28.32 
 
 
455 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  30.79 
 
 
457 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  30.24 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  30.17 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.68 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  29.19 
 
 
455 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  29.32 
 
 
767 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.48 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  30.77 
 
 
480 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  30.75 
 
 
433 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  31.65 
 
 
457 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  31.06 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  33.75 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  31.99 
 
 
788 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  30.72 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  31.33 
 
 
432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  31.06 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  35.29 
 
 
473 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.11 
 
 
452 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  25.33 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  31.6 
 
 
453 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  31.61 
 
 
629 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  32.22 
 
 
464 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  31.35 
 
 
451 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  27.11 
 
 
440 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  31.35 
 
 
451 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.72 
 
 
557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  26.73 
 
 
440 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  26.43 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  28.95 
 
 
440 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  34.56 
 
 
475 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  24.16 
 
 
433 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  27.83 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.72 
 
 
558 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  28.18 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  26.33 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  33.08 
 
 
483 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  29.55 
 
 
456 aa  133  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.36 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  32.36 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  26.71 
 
 
564 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  32.37 
 
 
689 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  30.43 
 
 
555 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  29.43 
 
 
666 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  29.37 
 
 
640 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  28.8 
 
 
567 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  27.97 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  29.89 
 
 
620 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  33.22 
 
 
619 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  26.42 
 
 
480 aa  126  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1620  kinase  32.28 
 
 
550 aa  126  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33 
 
 
565 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33 
 
 
565 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35349  predicted protein  31.95 
 
 
475 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0653065  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.97 
 
 
549 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  31.87 
 
 
517 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.56 
 
 
559 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.55 
 
 
509 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  31.01 
 
 
525 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.62 
 
 
458 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  30.6 
 
 
618 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  26.65 
 
 
555 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  28.04 
 
 
456 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>