More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8354 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  76.96 
 
 
437 aa  709    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  100 
 
 
445 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  69.68 
 
 
455 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  65.6 
 
 
574 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  65.9 
 
 
543 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  62.42 
 
 
451 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  59.4 
 
 
448 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  57.66 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  58.11 
 
 
448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  53.72 
 
 
443 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  56.94 
 
 
440 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  55.5 
 
 
436 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  57.56 
 
 
445 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  53.1 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  52.21 
 
 
447 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  50.23 
 
 
438 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  49.89 
 
 
438 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  46.8 
 
 
447 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  47.48 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  47.59 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  47.59 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  46.12 
 
 
445 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  45.66 
 
 
445 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  35.54 
 
 
462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  33.83 
 
 
454 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  31.7 
 
 
473 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  41.31 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  30.82 
 
 
432 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  33.49 
 
 
477 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  33.11 
 
 
481 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  34.92 
 
 
476 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  31.81 
 
 
451 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  33.86 
 
 
432 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  31.81 
 
 
451 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  33.33 
 
 
452 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.09 
 
 
469 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  30.5 
 
 
466 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  32.34 
 
 
461 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  35 
 
 
454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.5 
 
 
434 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  30.73 
 
 
767 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  34.38 
 
 
455 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  29.63 
 
 
454 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  29.07 
 
 
433 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  33.85 
 
 
457 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  32.55 
 
 
440 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  28.28 
 
 
433 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  30.99 
 
 
454 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  29.86 
 
 
457 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  31.84 
 
 
440 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  36.04 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  31.42 
 
 
450 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.93 
 
 
464 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  29.14 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  37.07 
 
 
629 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29.19 
 
 
438 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  32.66 
 
 
440 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  35.02 
 
 
452 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  34.65 
 
 
446 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.31 
 
 
557 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  29.27 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  26.44 
 
 
440 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  31.76 
 
 
455 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  27.76 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.49 
 
 
559 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  31.58 
 
 
640 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  30.13 
 
 
567 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
578 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.22 
 
 
530 aa  139  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  29.93 
 
 
458 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  34.31 
 
 
473 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  33.66 
 
 
564 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  30.84 
 
 
453 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  29.38 
 
 
455 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  29.41 
 
 
440 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  30.55 
 
 
572 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  30.55 
 
 
572 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  34.28 
 
 
456 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  33.92 
 
 
456 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  34.28 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  31.75 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  28.7 
 
 
560 aa  133  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  32.76 
 
 
485 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.08 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.12 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  35.63 
 
 
565 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  28.98 
 
 
517 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 
475 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  32.22 
 
 
549 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19051  hypothetical protein  33.71 
 
 
618 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  35.4 
 
 
549 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.3 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  31.85 
 
 
549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19041  hypothetical protein  32.8 
 
 
618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  31.63 
 
 
618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  28.75 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.23 
 
 
555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1806  putative protein kinase:ABC1 family  29.54 
 
 
618 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.396979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  38.62 
 
 
613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.15 
 
 
559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>