More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3146 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  80.44 
 
 
453 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  917    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  80.48 
 
 
456 aa  724    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  90.93 
 
 
453 aa  820    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  80.26 
 
 
456 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  80.44 
 
 
456 aa  727    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  73.66 
 
 
470 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  66.81 
 
 
453 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  70.04 
 
 
456 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  62.89 
 
 
461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  59.02 
 
 
455 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  56.82 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  52.05 
 
 
452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  49.43 
 
 
454 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.74 
 
 
473 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  35.67 
 
 
543 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.31 
 
 
434 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  34.12 
 
 
440 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  30.97 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.75 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  30.27 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  28.54 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  29.63 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  32.39 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  33.44 
 
 
451 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.44 
 
 
451 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  28.64 
 
 
476 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  31.07 
 
 
438 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  32.59 
 
 
466 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.26 
 
 
448 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  29.19 
 
 
499 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  29.84 
 
 
451 aa  156  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  30.06 
 
 
440 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  32.64 
 
 
464 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  29.66 
 
 
477 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.75 
 
 
455 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  29.13 
 
 
440 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  30.23 
 
 
457 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  27.96 
 
 
564 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  32.35 
 
 
445 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  34.77 
 
 
438 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  33.8 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  31.51 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  36.11 
 
 
558 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.84 
 
 
432 aa  147  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 
454 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  34.45 
 
 
436 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  29.76 
 
 
445 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  30.82 
 
 
441 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.2 
 
 
481 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  31.13 
 
 
446 aa  144  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30.41 
 
 
445 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  33.63 
 
 
443 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.75 
 
 
438 aa  143  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  30.24 
 
 
432 aa  143  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  30.55 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.81 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  31.92 
 
 
588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  30.77 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 
576 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.61 
 
 
549 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  27.91 
 
 
433 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.72 
 
 
537 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  34.11 
 
 
445 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  27.99 
 
 
480 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  28.2 
 
 
537 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.33 
 
 
556 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.47 
 
 
440 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  27.71 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  30.48 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  34.95 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  27.46 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.98 
 
 
558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  29.28 
 
 
473 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  33.96 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  32.31 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  29.58 
 
 
555 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  32.55 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  29.46 
 
 
583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.47 
 
 
557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 
475 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 
557 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  30.64 
 
 
517 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  28.98 
 
 
557 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  32.38 
 
 
583 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4100  ABC-1 domain-containing protein  27.76 
 
 
659 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  29.4 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.46 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.92 
 
 
561 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  34.21 
 
 
557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.16 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  34.73 
 
 
619 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  29.4 
 
 
582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  26.41 
 
 
666 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>