More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4857 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4857  ABC-1 domain protein  100 
 
 
646 aa  1269    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.982247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2198  ABC1 family protein  30.51 
 
 
648 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3188  ABC1 family protein  30.92 
 
 
648 aa  273  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2127  ABC1 family protein  31.07 
 
 
648 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2150  ABC1 family protein  30.51 
 
 
648 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5644  ABC-1 domain protein  36.72 
 
 
646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588147  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  32.23 
 
 
652 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.52 
 
 
558 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  28.45 
 
 
558 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.85 
 
 
558 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  38.46 
 
 
552 aa  220  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.26 
 
 
556 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 
557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.84 
 
 
558 aa  218  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.3 
 
 
555 aa  209  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.68 
 
 
561 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  32.61 
 
 
547 aa  206  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  34.75 
 
 
562 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  29.69 
 
 
557 aa  205  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  28.35 
 
 
558 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  30.02 
 
 
556 aa  204  6e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.58 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  27.08 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.51 
 
 
573 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.39 
 
 
561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  29.71 
 
 
565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  30.14 
 
 
551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  29.71 
 
 
565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.32 
 
 
599 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  31.03 
 
 
591 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  37.33 
 
 
550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  30.74 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.1 
 
 
563 aa  197  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  28.62 
 
 
571 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.61 
 
 
559 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  34.44 
 
 
556 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.19 
 
 
584 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.49 
 
 
547 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  34.22 
 
 
610 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  29.05 
 
 
557 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.99 
 
 
501 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.28 
 
 
501 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  31.61 
 
 
561 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  34.29 
 
 
588 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  31.88 
 
 
582 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  28.14 
 
 
562 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.69 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.13 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  30.73 
 
 
566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  28.74 
 
 
578 aa  190  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  28.46 
 
 
585 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  31.45 
 
 
547 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.33 
 
 
509 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.74 
 
 
558 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  30.71 
 
 
547 aa  188  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  32.55 
 
 
557 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  30.42 
 
 
560 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0603  unusual protein kinase  27.94 
 
 
549 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  30.99 
 
 
559 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  31.02 
 
 
582 aa  187  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.15 
 
 
547 aa  187  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.91 
 
 
522 aa  187  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.49 
 
 
559 aa  187  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  28.38 
 
 
576 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.56 
 
 
560 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  27.47 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.59 
 
 
525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  30.52 
 
 
544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1668  ABC-1 domain protein  32.34 
 
 
657 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.670812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.23 
 
 
549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  27.09 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.16 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  31.34 
 
 
556 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  31.34 
 
 
543 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.32 
 
 
563 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  31.34 
 
 
543 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  27.96 
 
 
552 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  34.45 
 
 
563 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.81 
 
 
527 aa  184  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  33.43 
 
 
583 aa  184  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 
544 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  28.54 
 
 
561 aa  183  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  29.53 
 
 
571 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.08 
 
 
559 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.09 
 
 
551 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0686  hypothetical protein  32.06 
 
 
553 aa  182  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.49 
 
 
549 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  27.23 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  27.23 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.86 
 
 
504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.18 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  30 
 
 
565 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  26.3 
 
 
537 aa  180  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.55 
 
 
517 aa  180  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.14 
 
 
559 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.85 
 
 
559 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.07 
 
 
592 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  30.68 
 
 
581 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  29.46 
 
 
561 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>